kapsidový protein poskytuje druhé hlavní kritérium pro klasifikaci virů. Capsid obklopuje virus a je složen z konečného počtu proteinových podjednotek známý jako capsomeres, které obvykle spojujeme s, nebo se nacházejí v blízkosti, virion nukleové kyseliny.
Existují dvě hlavní třídy viry založené na kapsidový protein: (1) ty, v nichž jeden (nebo segmentová) lineární nukleové kyseliny, molekuly s dva volné konce je v podstatě úplně prodloužena, nebo mírně stočený (šroubovice) a (2) ty, v nichž nukleové kyseliny, které mohou nebo nemusí být kovalentně uzavřený kruh, je navinuta pevně do zhuštěné konfigurace, jako klubko nití. Tyto dvě třídy viru předpokládají v prvním případě dlouhou, rozšířenou tyčovitou strukturu a ve druhém případě symetrický mnohoúhelník.
zdaleka nejlépe studovaným příkladem viru ve tvaru spirály je virus tabákové mozaiky, který krystalizoval Wendell Stanley v roce 1935. Tabákový mozaikový virus obsahuje genom single-stranded RNA obalené tím, 2,130 molekul jednoho proteinu, tam jsou 161/3 molekuly bílkovin při každém otočení šroubovice RNA v poměru tři nukleotidy pro každý protein molekuly.
Encyclopædia Britannica, Inc.
Za správných podmínek prostředí, virové RNA a proteinové molekuly v kapalné suspenze se shromáždí do sebe dokonale tvarované a plně infekční virus. Délka spirálové virové kapsidy je určena délkou molekuly nukleové kyseliny, která je rámcem pro sestavení kapsidového proteinu. Různé spirálové viry mají různé délky a šířky, v závislosti na velikosti nukleové kyseliny, jakož i na hmotnosti a tvaru molekuly proteinu. Některé z těchto spirálových virů tvoří tuhé tyče, zatímco jiné tvoří pružné tyče, v závislosti na vlastnostech sestavených proteinů.
Polygonální viry se velmi liší ve velikosti, od 20 do 150 nm v průměru, v podstatě úměrná velikosti nukleové kyseliny, molekuly stočený uvnitř virion. Většina, ne-li všechny, polygonálních virů je ikosahedrální; jako geodetická kopule jsou tvořeny rovnostrannými trojúhelníky, v tomto případě 20. Každý trojúhelník se skládá z proteinových podjednotek (kapsomer), často ve formě šestiúhelníků (násobků šesti), které jsou stavebními kameny kapsidy. Existuje 12 vrcholů (apikální křižovatky těchto 20 trojúhelníků), z nichž každý obsahuje penton (pět podjednotek). Tyto ikosahedrální viriony mají tři osy pětinásobné, trojnásobné a dvojnásobné rotační symetrie. Počet kapsomer je základem taxonomické klasifikace těchto virových rodin. Některé dvacetistěnná viry, obvykle ty, které jsou složitější, obsahují vnitřní proteiny lpění na nukleové kyseliny, které nejsou přístupné na povrchu virionů.
Encyclopædia Britannica, Inc.