Dokud komplexy jsou vyrobeny vědomí a propracoval, jak se běžně provádí v neo-Jungovské psychoterapie, fungují „nezávisle a v rozporu se záměry bude, narušení paměti a vědomé výkon“.
samotné ego lze považovat za komplex, který ještě není plně integrován s jinými částmi psychiky(jmenovitě superego a id nebo nevědomí). Jak popsal Jung, „egem chápu komplex myšlenek, které tvoří centrum mého pole vědomí a zdá se, že mají vysoký stupeň kontinuity a identity. Proto také mluvím o komplexu ega“.
Jung často používá termín „komplex“ k popisu částečně potlačil, ale velmi vlivný shluk nabitých psychické materiál oddělí od, nebo v rozporu s, vědomé „já“. Daniels (2010) popsal komplexy jako „slepené“ aglomerace myšlenek, pocitů, vzorců chování a somatických forem vyjádření“. O jeho povahu jako pocit-tónovaný, Jung napsal, “ je to obraz určité psychické situace, která je silně zvýrazněná a citově je navíc neslučitelná s obvyklým postojem vědomí. Tento obraz má silný vnitřní soudržnost, to má své vlastní celistvosti, a, kromě toho, relativně vysoký stupeň autonomie, tak, že je pod kontrolou vědomé mysli pouze v omezené míře, a proto se chová jako animovaný cizí těleso v oblasti vědomí.“
některé komplexy mohou uzurpovat sílu z ega a mohou způsobit psychologické poruchy a příznaky vyplývající z vývoje neurózy. Jung popsal autonomní, self-režie povaze komplexů, když řekl,
„to, co není tak dobře známo, ale daleko více důležité, teoreticky, je, že komplexy mohou mít nás. Existence komplexů vyvolává vážné pochybnosti o naivním předpokladu jednoty vědomí, která se rovná „psychice“, a o nadřazenosti vůle. Každá konstelace komplexu postuluje narušený stav vědomí. Jednota vědomí je narušena a záměry vůle jsou narušeny nebo znemožněny. Jak jsme viděli, i paměť je často znatelně ovlivněna. Komplex proto musí být psychický faktor, který je z hlediska energie, má hodnotu, která někdy přesahuje naše vědomé záměry, jinak takové narušení vědomé cílem by nemělo být možné vůbec. A ve skutečnosti, aktivní komplex nás staví na okamžik za stavu nátlakem, nutkavé myšlení a jednání, které za určitých podmínek pouze vhodný termín by byl právní pojem zmenšená příčetnost“
Na druhou stranu, Jung mluvil o „rozlišování funkcí“ jako v podstatě zdravý vývoj užitečných komplexy, přesto ne bez přinášející často nežádoucí vedlejší účinky.
“ je pravda, že to nemluvíme jako posedlost komplexem, ale jako jednostrannost. Stále, aktuální stav je přibližně stejný, s tím rozdílem, že jednostrannost je určena na individuální a je podporována všemi prostředky ve své moci, vzhledem k tomu, že komplex je pocit, být nebezpečnou a znepokojující. Lidé často nevidí, že vědomě ochotná jednostrannost je jednou z nejdůležitějších příčin nežádoucího komplexu a že naopak určité komplexy způsobují jednostranné rozlišení pochybné hodnoty.
V Psychologické Typy, Jung popisuje účinky napětí mezi dominantní a nižší rozlišení funkce, často tvoří komplexy a neurózy, ve vysoce a dokonce i velmi jednostranné typy.
„Ve výše uvedené popisy netoužím po tom, aby moji čtenáři dojem, že tyto typy se vyskytují na všech často v takové čisté formě ve skutečném životě. Jsou, jak to bylo, jen Galtonesque rodinné portréty, které jediné společné, a proto typické rysy, a zdůraznil, je nepoměrně více, zatímco jednotlivé funkce jsou jen jako nepřiměřeně smazány.