V N hráč ovládá ninja, který naviguje úrovně založené na dlaždicích a současně se vyhýbá nebezpečím, sbírá zlato a nakonec otevírá výstupní dveře, které dokončí úroveň. Hra zahrnuje čtyři klávesy-tah-levý klíč (výchozí šipka vlevo), tah-pravý klíč (výchozí šipka vpravo), skákání (výchozí klávesa shift, ačkoli Z klíč je běžnou alternativou) a sebevražda(výchozí klávesa k). Kombinace pohybu a skákání na různých typech terénu umožňují ninja provádět různé pohyby, jako je skákání ode zdi ke zdi, lezení vertikální stoupání a sjíždění strmých plochách.
Verze 1.4 N obsahuje 100 epizod (číslo 00 až 99), zatímco verze 2.0 obsahuje 120 epizod (kvůli dvěma bonus sloupce je unlockable po dokončení hlavní hry epizod). Každá epizoda ve všech iteracích hry obsahuje pět úrovní (číslovaných 0 až 4). N také podporuje uživatelské úrovně. To se provádí pomocí vestavěného editoru úrovní s názvem NEd nebo „N Editor“. Úrovně mohou být přidány do hry úpravou textový soubor doprovázející hru, která obsahuje údaje o úrovni uživatele.
n 1.4 má celkem 500 map, z nichž 450 je vyrobeno softwarem Metanet; 2.0 obsahuje 600 úrovní,z nichž 500 je vyrobeno softwarem Metanet. Zbývajících 50 úrovní v 1.4 jsou uvedené uživatelské úrovně, které byly ručně vybral Metanet v roce 2005, zatímco zbývajících 100 úrovní ve verzi 2.0 byly user-made úrovních vybrán porotou fanoušci na konci roku 2012 a byla dokončena Metanet Software v roce 2013. (Tým za výběrem užšího výběru byl uveden v kreditech hry pod jejich příslušnými aliasy.) Cílem každé úrovně je spustit spínač a vystoupit dveřmi, které se otevírají ve stanovené lhůtě. Některé úrovně mají více než jeden výjezd a přidružený přepínač, což dává hráči větší volnost při rozhodování o své trase a způsobu dokončení mapy. Každá epizoda má kumulativní časový limit. Na začátku úrovně 0, hráč dostane 90 sekund na dokončení dalších pěti úrovní. Časový limit epizody lze zvýšit sbíráním zlata, což přidává dvě sekundy za kus. Zbývající čas na konci každé úrovně se přenese na další úroveň. Jedinou výjimkou je konečná úroveň, ve které se zbývající čas stává skóre této epizody.