i N styrer spilleren en ninja, der navigerer på flisebaserede niveauer, samtidig med at man undgår farer, samler guld og til sidst åbner en udgangsdør, der fuldender niveauet. Gameplay involverer fire taster – en Flyt-venstre tast (standard venstre pil), en Flyt-højre tast (standard højre pil), Spring (standard Skift-tast, selvom å-tast er et almindeligt alternativ) og selvmord (standard K-tast). Kombinationer af bevægelse og hoppe på forskellige typer terræn gør det muligt for ninjaen at udføre en række bevægelser, såsom at hoppe fra væg til væg, klatre op ad lodrette hældninger og glide ned ad stejle overflader.
Version 1.4 af N indeholder 100 episoder (nummereret 00 til 99), mens version 2.0 indeholder 120 episoder (på grund af at to bonuskolonner kan låses op efter afslutningen af hovedspilepisoderne). Hver episode i alle gentagelser af spillet indeholder fem niveauer (nummereret 0 til 4). N understøtter også brugerdefinerede niveauer. Dette gøres gennem en indbygget niveaueditor kaldet NEd eller”N Editor”. Niveauer kan tilføjes til et spil ved at ændre en tekstfil, der ledsager spillet, der indeholder data på brugerniveau.
N 1.4 har i alt 500 kort, hvoraf 450 er lavet af Metanet-programmer; 2.0 indeholder 600 niveauer, hvoraf 500 er lavet af Metanet-programmer. De resterende 50 niveauer i 1.4 Er førnævnte brugerniveauer, der blev håndplukket af Metanet i 2005, mens de resterende 100 niveauer i 2.0 var brugervenlige niveauer valgt af et panel af fans i slutningen af 2012 og blev afsluttet af Metanet i 2013. (Holdet bag shortlistevalget blev opført i spillets kreditter under deres respektive aliaser.) Målet med hvert niveau er at udløse kontakten og gå ud gennem døren, den åbnes inden for fristen. Nogle niveauer har mere end en udgang og tilhørende kontakt, hvilket giver spilleren mere frihed til at bestemme deres rute og metode til at udfylde kortet. Hver episode får en kumulativ frist. I begyndelsen af niveau 0 får spilleren 90 sekunder til at gennemføre de næste fem niveauer. Episodens tidsbegrænsning kan øges ved at samle guld, hvilket tilføjer to sekunder pr. Tiden tilbage i slutningen af hvert niveau overføres til næste niveau. Den eneste undtagelse er det endelige niveau, hvor den resterende tid bliver episodens score.