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4.3: Acides aminés

La colonne vertébrale des acides aminés

Le nom « acide aminé » est dérivé du fait que tous les acides aminés contiennent à la fois un groupe amino et un groupe acide carboxylique dans leur colonne vertébrale. Il y a 20 acides aminés communs présents dans les protéines naturelles et chacun d’entre eux contient la même colonne vertébrale. L’épine dorsale, en ignorant les atomes d’hydrogène, est constituée du motif:

N-C-C

Lorsque vous regardez une chaîne d’acides aminés, il est toujours utile de vous orienter d’abord en trouvant ce motif dorsal à partir de l’extrémité N (l’extrémité aminée du premier acide aminé) jusqu’à l’extrémité C (l’extrémité acide carboxylique du dernier acide aminé).

La formation de liaisons peptidiques est une réaction de synthèse de déshydratation. Le groupe carboxyle du premier acide aminé est lié au groupe amino du deuxième acide aminé entrant. Dans le processus, une molécule d’eau est libérée et une liaison peptidique est formée.
Essayez de trouver l’épine dorsale dans le dipeptide formé à partir de cette réaction. Le motif que vous recherchez est: N-C-C-N-C-C

Attribution: Marc T. Facciotti (travail propre)

La séquence et le nombre d’acides aminés déterminent finalement la forme, la taille et la fonction de la protéine. Chaque acide aminé est attaché à un autre acide aminé par une liaison covalente, appelée liaison peptidique, qui est formée par une réaction de synthèse de déshydratation (condensation). Le groupe carboxyle d’un acide aminé et le groupe aminé de l’acide aminé entrant se combinent, libérant une molécule d’eau et créant la liaison peptidique.

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