az aminosav gerinc
az “aminosav” elnevezés abból a tényből származik, hogy minden aminosav tartalmaz mind egy aminocsoportot, mind karboxil-savcsoportot a gerincükben. A természetes fehérjékben 20 közös aminosav van jelen, amelyek mindegyike ugyanazt a gerincet tartalmazza. A gerinc, amikor figyelmen kívül hagyja a hidrogénatomokat, a mintából áll:
N-C-C
amikor egy aminosavláncot vizsgálunk, mindig hasznos először tájékozódni azáltal, hogy megtaláljuk ezt a gerincmintát az N terminálistól (az első aminosav amino vége) a C terminálisig (az utolsó aminosav karbonsav vége).
a peptidkötés kialakulása dehidratációs szintézis reakció. Az első aminosav karboxilcsoportja kapcsolódik a második bejövő aminosav aminocsoportjához. A folyamat során egy vízmolekula szabadul fel, és peptidkötés képződik.
próbálja meg megtalálni a gerincet az ebből a reakcióból kialakult dipeptidben. A keresett minta: N-C-C-N-C-C
Attribution: Marc T. Facciotti (saját munka)
a szekvencia és az aminosavak száma végső soron meghatározza a fehérje alakját, méretét és funkcióját. Mindegyik aminosav egy másik aminosavhoz kapcsolódik egy kovalens kötéssel, amelyet peptidkötésnek neveznek, amelyet dehidratációs szintézis (kondenzáció) reakció képez. Az egyik aminosav karboxilcsoportja és a bejövő aminosav aminocsoportja egyesül, felszabadítva egy vízmolekulát és létrehozva a peptidkötést.