The Amino Acid Backbone
Il nome “amino acid” deriva dal fatto che tutti gli amminoacidi contengono sia un gruppo amminico che un gruppo carbossilico-acido nella loro spina dorsale. Ci sono 20 aminoacidi comuni presenti nelle proteine naturali e ciascuno di questi contiene la stessa spina dorsale. La spina dorsale, quando si ignorano gli atomi di idrogeno, consiste nel modello:
N-C-C
Quando si osserva una catena di aminoacidi è sempre utile orientarsi per prima cosa trovando questo schema di spina dorsale a partire dal N terminale (l’estremità amminica del primo amminoacido) al C terminale (l’estremità acido carbossilico dell’ultimo amminoacido).
La formazione di legami peptidici è una reazione di sintesi di disidratazione. Il gruppo carbossilico del primo amminoacido è collegato al gruppo amminico del secondo amminoacido in entrata. Nel processo, una molecola di acqua viene rilasciata e si forma un legame peptidico.
Prova a trovare la spina dorsale nel dipeptide formato da questa reazione. Il pattern che stai cercando è: N-C-C-N-C-C
Attribuzione: Marc T. Facciotti (own work)
La sequenza e il numero di amminoacidi determinano in ultima analisi la forma, la dimensione e la funzione della proteina. Ogni amminoacido è attaccato ad un altro amminoacido da un legame covalente, noto come legame peptidico, che è formato da una reazione di sintesi di disidratazione (condensazione). Il gruppo carbossilico di un amminoacido e il gruppo amminico dell’amminoacido entrante si combinano, rilasciando una molecola d’acqua e creando il legame peptidico.