La Florida High School Athletic Association è stata fondata il 9 aprile 1920 da un gruppo di 29 presidi delle scuole superiori che si sono incontrati nel campus dell’Università della Florida a Gainesville. L’organizzazione è stata fondata come Florida High School Athletic Association. Il nome è stato cambiato in Florida High School Activities Association nel 1951. Il nome è stato cambiato in Florida High School Athletic Association nel 2002.
Le 29 scuole che divennero soci fondatori erano: Summerlin (Bartow), Clearwater, Terraferma (Daytona Beach), Seabreeze (Daytona Beach), DeLand, Fort Lauderdale, Fort Myers, Gainesville, Duval (Jacksonville), Osceola (Kissimmee), Columbia (Lake City), Lakeland, Leesburg, Suwannee (Live Oak), Miami, Orlando, Orlando, Putnam (Palatka), Pensacola, Plant City, Quincy, Seminole (Sanford), Ketterlinus (S. Agostino), San Pietroburgo, Leon (Tallahassee), Hillsborough (Tampa), Hardee’ (Wauchula), West Palm Beach, e Winter Haven.
La prima Costituzione limitava l’adesione alle scuole pubbliche. Tuttavia, nel 1930, fu modificato per aprire l’adesione anche alle scuole private e parrocchiali.
Nel 1951, le scuole membri votarono per cambiare la parola “atletica” in “attività” nel nome dell’organizzazione in modo che anche le attività non atletiche come la musica e i programmi del consiglio studentesco ricevessero un’adeguata supervisione a livello statale.
L’Associazione è stata costituita nel 1962. Mentre la carta dell’associazione non aveva mai escluso specificamente la partecipazione degli studenti non bianchi, nessuno in realtà ha partecipato fino al 1967, quando la Gibbs High School tutta nera non solo ha partecipato al basket ma ha vinto il campionato statale. Nel 1968 la FIAA si sciolse. La FHSAA non ha mai integrato in modo completo i risultati delle scuole superiori nere nei loro registri.
Nel 1996 la FHSAA ha adottato regolamenti che consentono agli studenti iscritti a programmi di educazione domestica di partecipare ad attività interscholastiche. I regolamenti avrebbero poi consentire futuro Heisman Trophy quarterback Tim Tebow a partecipare al calcio delle scuole superiori; regole simili adottate in seguito da altri stati sarebbe quindi chiamato il “Tebow rule”.
Nel maggio 1997, il legislatore della Florida ha riconosciuto nello statuto la FHSAA come organo di governo per l’atletica interscholastica in Florida, a condizione che l’Associazione rispetti le disposizioni di un revamping legislativo della sua struttura governativa.
Il nome è stato cambiato in Florida High School Athletic Association nel 2002. A partire da agosto 2007, la FHSAA ha un’adesione di 748 scuole.
Nel 2017, l’associazione ha adottato un metodo a punti per classificare le squadre di calcio per i playoff del campionato statale. I punti vengono assegnati sulla base di vittorie e sconfitte, record avversari e record di playoff passati.