大学は、ウィリアム-ジェサップ、学校の最初の社長によって、サンノゼで、1939年にサンノゼバイブルカレッジとして設立されました。 ユージン-クレアモント-サンダーソンは1934年にサンノゼでエヴァンゲル聖書大学と呼ばれる学校を始めたが、それを実行可能にすることができなかった。 その結果、彼は彼の元学生の一人であるWilliam Jessupを後任に募集しました。 1951年までに学校が拡張され、通りの向こう側にサンホセ州立大学が侵入すると、サンホセ聖書大学はコヨーテクリーク、12番街に隣接する区画に移動し、30年近く後にI-280によって移動した。 スペイン風の教室の建物といくつかの寮の建物が小さなキャンパスを構成しました。ウィリアム-ジェサップは1960年に引退し、アルヴァン-L-ティフィンが後継者となった。 その後、卒業生であるウッドロウ-フィリップスが1968年から1979年まで社長を務め、チャック-ボートマンが1979年から1984年まで社長を務めた。 ドクター-オブ-ザ-イヤー ブライス-ジェサップはペパーダイン大学の卒業生であり、元大統領の息子であり、引退した1984年から2010年まで大統領を務めた。 ジョン・ジャクソン博士は2011年3月に第6代大統領に選出されました。1989年にサンノゼ-クリスチャン-カレッジと改名され、2002年にwascによって地域認定された。 行政はサンタクララバレーに新しい場所を見つけることができなかったため、2003年4月にサクラメント大都市圏のロックリンに移転することが決定された。 大学は2004年6月に正式にサンノゼキャンパスから移転した。 この時、大学はウィリアム-ジェサップ大学と改名された。 サンノゼには支部キャンパスがあり、主に非伝統的な学生や大学院生を提供しています。
現在の場所は以前はハーマンミラーの家具工場であり、建物の多くはFrank Gehryによって設計されました。