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コレステロールがリン脂質二重層の構造に及ぼす影響

要約

コレステロールは、リン脂質膜の特性を調節する上で重要な役割を果 脂質–コレステロール相互作用の詳細な理解を得るために、我々はメソスコピック水–脂質–コレステロールモデルを開発しました。 このモデルでは、疎水性–親水性相互作用と分子の構造を考慮しています。 散逸粒子動力学を用いてジミリストイルホスファチジルコリン–コレステロールの相図を計算し,このモデルが実験的に観測されている異なる相の多くを予測することを示した。 実験データと定量的に一致して,このモデルは凝縮効果を示した。 計算により,この効果は膜が液相にある最低温度である主相転移温度に最大近く,コレステロール添加時のこの主相転移温度の増加に直接関係することを示した。 余分な親水性ヘッド基を添加してコレステロール分子の構造をわずかに変化させたり、コレステロールの疎水性部分のサイズを小さくしたりすると、凝縮は観察されないことを示した。

キーワード:

  • 生体膜
  • 分子シミュレーション
  • 相挙動
  • dimyristoylphosphatidylcholine
  • メソスコピックモデル

この記事では、一見単純な熱力学的な質問に対処します。 この質問は1925年にLeathes(1)によって最初に提起され、今日でも議論されています。 この質問の意義は、高等真核生物の膜の機能に対するコレステロールの重要性に直接関連している。 例えば、コレステロールは膜の流動性を調節し、膜タンパク質の機能を調節します(2)。 これらのメカニズムを理解することは、脂質–コレステロール相互作用を詳細に調査するために多くの研究者を動機としている。 膜は2次元液体として見ることができるので、分子あたりの面積がコレステロールの添加時にどのように変化するかの最初の推定値は、分子あたりの面積が単に純粋な成分領域の加重平均である理想的な混合を仮定することであろう。 1925年にLeathesは、理想的な混合の代わりに、印象的な非理想的な行動を観察することを示した(1)。 この非理想的な挙動は、分子当たりの面積が理想的な混合と比較してはるかに低いため、凝縮効果(3)と呼ばれています。 膜は非圧縮性流体として振る舞うため、分子あたりの面積の減少は、二重層の総厚さの対応する有意な増加をもたらす。 このような厚さの増加は、膜の構造の再編成を示す。 膜の構造の変化はタンパク質の機能に重要な結果をもたらす可能性があるため(2)、コレステロール誘発性の変化のより良い分子理解を持つことが重非理想的なコレステロール–脂質相互作用を説明するために、異なる概念モデルが提案されている。

非理想的なコレステロール-脂質相互作用を説明す 例としては、縮合錯体モデル(4,5)、超格子モデル(6)、アンブレラモデル(7)などがある。 縮合複合体モデルは,コレステロールが化学量論的コレステロール–脂質複合体の可逆的形成を誘導すると仮定することによって縮合効果を説明する。 このような複合体では、脂質アシル鎖がより秩序化されるにつれて膜が凝縮される。 所与のコレステロール濃度では、これらの凝縮コレステロール–脂質複合体と通常の脂質との間に平衡組成が存在する。 超格子モデルは、臨界濃度でコレステロール分子が特定の長距離秩序を示すことを前提としている。 アンブレラモデルは,コレステロールの親水性部分が小さすぎるため,脂質は水との疎水性相互作用からコレステロール分子のスクリーニングに寄与する必要があるという視点をとっている。 リン脂質は、これらの分子がコレステロールのためのスペースを作るためにまっすぐにした場合にのみ、この傘を作成することができます。 これらのモデルでは、凝縮につながる基礎となるメカニズムは非常に異なっています。 興味深いことに、最近の実験的研究では、それらのデータが凝縮複合体モデル(8)を支持していると結論づけられたが、別の一連の実験では凝縮複合体の兆候は見られず、アンブレラモデル(9)を支持していた。 洞察力のこれらの違いは、脂質–コレステロール–水システムのメソスコピックモデルを開発するために私たちを動機付けた。 我々は、脂質膜におけるコレステロールの側方組織と凝縮効果を誘導する基礎となる脂質–コレステロール相互作用にいくつかの光を当てるために分子シ

脂質二重層におけるコレステロールの全原子および粗粒モデルのいくつかの分子シミュレーションが文献で報告されている(いくつかの最近の例 10-13およびその中の参考文献)。 理想的には、全原子シミュレーションを使用して、広い範囲の温度と組成にわたって凝縮効果を研究したいと考えています。 しかし、現時点では、これらのシミュレーションには時間がかかりすぎます。 したがって、全原子モデルの詳細の一部を積分することによって効率が得られる粗粒モデルを使用します。 私たちのモデルは、Kranenburgと同僚のモデルに基づいています(14、15)。 このモデルでは、明示的な水分子を使用します。 脂質およびコレステロールは、親水性および疎水性粒子からなる(図参照)。 1). このモデルは、原子のグループを一つのメソスコピック擬原子に塊状にします。 分子内相互作用には結合振動と結合曲げが含まれ,そのパラメータは水中の単一全原子ホスファチジルコリン分子の構造を模倣するように最適化されている。 親水性および疎水性相互作用は、ソフト反発相互作用で記述されており、これらの相互作用のパラメータは、GrootとRabone(16)によって記述された方法を使用して溶解性パラメータに関連している。 このモデルのアイデアは、コレステロール–リン脂質混合の主な駆動力は、多くの実験的研究(の結論である疎水性と親水性の相互作用であるということ 我々のモデルでは、長さの単位は、擬似原子の有効サイズに直接関連している、すなわち、一つの擬似原子は90Å3の体積を占める。 エネルギーの単位は,メソスコピック水粒子の軟反発パラメータの周囲条件での水の圧縮性に一致することから従う。 モデルの単純さは、温度が変更された場合、これらのソフト反発の再パラメータ化を必要とします。 しかし,この研究では,パラメータは温度に依存しないと仮定した。 温度スケールは実験相転移温度に当てはめることによって設定した。 このモデルのさらなる詳細と応用は、参考文献に記載されています。 18.

iv xmlns:xhtml=”http://www.w3.org/1999/xhtml図。 1.

本研究で研究されているメソスコピックモデルの模式図。 (A及びb)図は、DMPC(a)及びコレステロール(B)を表す。 モデルはばねおよび結束曲がる潜在性と接続される疎水性(白い)および親水性の(黒い)ビードを含んでいる。 このモデルには、親水性ビーズとしてモデル化された明示的な水分子が含まれています。 コレステロールの化学構造の変化の影響を研究するために、我々はコレステロールの疎水性–親水性バランスを変化させる三つの”新しい”分子を導入する。 (C)短い尾の長さを持つコレステロール。 (D)より親水性であるコレステロール。 (E)疎水性が低いコレステロール。

図に示すコレステロールの私たちのモデル。 有効なサイズおよび相互作用についての脂質モデルと同じ仮定に基づいている。 McMullen et al. (19)、我々はジミリストイルホスファチジルコリン(DMPC)を表すことを目的とした脂質モデルの疎水性部分よりもコレステロールモデルの疎水性部分をわずかに長くした。 簡単にするために、我々は、コレステロール分子の疎水性および親水性の相互作用が脂質中の相互作用に類似していると仮定した。 コレステロールの縮合効果の分子機構を解明するために、分子の疎水性-親水性バランスを乱す三つのコレステロール様分子を導入しました(図参照)。 疎水性基を付加したもの(図1C)、疎水性基を付加したもの(図1C)を含む。 環を単純な鎖で置換したもの(図1D)、および環を単純な鎖で置換したもの(図1D)である。 1E)。

図。 図2は、水–リン脂質–コレステロール系の計算された温度組成相図を示す。 位相境界はスナップショットの目視検査から得られ,より定量的には脂質あたりの面積,膜の平均疎水性厚さ,尾の順序と傾きパラメータを与える曲線の変曲点から得られた。 これらの特性を温度とコレステロール含量の関数として計算した。

図10に示すように、

2.

相図と様々な相の構造。 (左)温度(摂氏度)とコレステロール濃度の関数としての計算された相図。 黒い線は位相境界を与えます。 色分けは、青は非常に少ない凝縮を示し、オレンジは大きな凝縮効果を示し、与えられた状態点で凝縮効果を与える。 (右)各フェーズの模式図。 L A、液相中の脂質;P’β、リップル相;L’β、傾いた脂質鎖を有するゲル相;L’c、傾いていない脂質鎖を有するゲル相;LII、小さなコレステロールクラスターを含むl’cに類似したゲル相;Lo、液体秩序相。 凝縮効果は、理想的なAM、simおよびAMの間の差として、Å2で定義されます。

最初に純粋な脂質相に焦点を当て、次にコレステロールの効果について説明します。 純粋な脂質二重層については、相図は、4倍小さい系についてKranenburgとSmit(14)によって計算されています。 我々は、KranenburgとSmitが行ったように位相境界を見つけるために同じ方法論を使用しました(14)。 この結果は本研究と良く一致し,有限サイズ効果は小さいことを示した。 純粋なりん脂質では,高温で尾部が無秩序になる液相(L a)を観察した。 低温では、ゲル相(L’c)を定義する尾部が順序付けられ、傾いている。 これら二つの相は波状相(P’β)によって分離され,二重層が厚く脂質が秩序化しているドメインと二重層が薄く脂質が無秩序化しているドメインのミクロ相分離を観察した。 これらの3つの相の存在は、得られた相図が純粋な脂質(2 0)の実験図と非常に良好に一致していることを示している。 温度スケールは,ゲル相からリップル相(T p)への相転移およびリップル相から液相(T m)への相転移の温度を,純粋なDMPCの対応する実験相転移温度と一致させることによって設定した。 実験データとのさらなる比較は、二分子層の分子当たりの平均面積について行われる(図1)。 図3A)、二層の厚さについては(図3a)。 (図4A)、および脂質尾位について(図4A)、および脂質尾位について(図4A)。 4B)。 脂質あたりの面積については、実験(21)分子あたり60Å2と比較して分子あたり56Å2を得る。 二重層の厚さについては、38.7Åの値を計算し、これは実験値36Å(21)とよく比較し、テールオーダーについても同様の一致が得られた(図参照)。 4B)。 純粋なコレステロールの分子あたりの面積を計算するために,純粋なコレステロールの二重層をシミュレートした。 我々は、コレステロールの単分子層のための41Å(22)の最新の実験値と非常によく比較する40.3Åの値を得た。 このモデルで行われた近似を考慮すると,実験値とシミュレーション値との間の一致は驚くほど良好である。

図10に示すように、

3.

図に示す分子に対するコレステロール濃度の関数としての分子当たりの面積。 1. コレステロール(A)および修飾コレステロール(B)分子のデータを図に示す。 1C-E.(A)Hungらの実験データを比較します。 (21)シミュレーション結果と理想的な混合推定値を使用します。 この推定値は、a m、mix=(1−x c)A L+XCACによって与えられ、x cはコレステロールのモル分率として与えられる。 A lおよびA Cは、それぞれ、脂質当たりの純成分面積およびコレステロール当たりの面積である。 実験データとシミュレーションは両方ともT=30℃であった。 (B)コレステロールの疎水性–親水性バランスの変化の影響;円は親水性部分が増加したコレステロール、正方形は疎水性部分が減少したコレステロール、三角形は尾長が短いコレステロールである(図参照)。 1).

図。 4.

コレステロール濃度の関数としてのDMPC–コレステロール系の相対二重層厚さ(A)と秩序パラメータ(B)。 (A)Panらの実験データを比較した。 (3 0)およびHung e t a l. (21)私たちのシミュレーションの結果と。 相対的な二重層の厚さの膨張はd/d0として定義され、dは電子密度プロファイルにおけるリン-リン間距離、d0は純粋な二重層の厚さである。 (B)実験データは、Pan e t a l. (3 0)およびMills e t a l. (31). 配向性脂質テール秩序パラメータSNMRは、SNMR=0.5≤3cos θ2−1θとして定義され、θは鎖内の二つのビーズに沿ったベクトルの配向と二層平面に対する法線との間の角度として定義され、平均はすべてのビーズにわたるアンサンブル平均の平均である。 Sx-rayは、角度θが最初と最後の尾ビーズに沿ったベクトルの向きと二重層平面に対する法線の間にあるのと同じ式を使用して、脂質の鎖の平均傾斜を 実験データとシミュレーションは、T=30℃での両方であった

私たちは今、二層の特性にコレステロールの影響に目を向けてみましょう。 私たちが対処する最初の質問は、私たちのモデルが凝縮効果を再現できるかどうかです。 図1.1.1. 図3Aは、コレステロール濃度の関数としての分子当たりの面積に対するコレステロールの効果を示す。 実験データとの比較は再び非常に良い一致を示した。 この図では、理想的な混合を仮定した分子あたりの面積も示しています。 この図は凝縮効果を説得力を持って示しています;分子あたりの面積は理想的な混合に基づいて予想されるよりもはるかに多く減少します。 他の実験データには、二重層腫脹に対するコレステロールの影響が含まれる(図1)。 図4A)および尾順序パラメータ(図4a)。 4B)。 実験データとシミュレーションの両方から,コレステロールは二層の厚さとその秩序を増加させることを示した。 また,これら二つの特性についても,シミュレーション結果は実験データと非常に良く一致した。 シミュレーションおよび実験データ(図。 3Aおよび4AおよびB)は、コレステロールの添加が±30mol%コレステロールまでの脂質二重層の特性を強く修飾することを示す。 この後で、地域はコレステロールのそれ以上の付加がわずかな効果だけもたらすところで達されます。 30mol%のコレステロールで、分子ごとの区域および脂質の尾順序および傾き変数にゲル段階のために典型的である価値があります。

図中の色コーディング。 図2は、脂質あたりのシミュレートされた面積と理想的な混合を仮定して推定された値との差を示す。 高温および低温では、凝縮効果は比較的小さいことが観察されます。 凝縮効果は純粋なりん脂質の主相転移のすぐ上に位置する相空間における明確に定義された領域で最大である。 凝縮効果の性質をよりよく理解するためには、膜の相挙動に対するコレステロールの添加の効果を理解することが重要である。

図。 図2は、相図の最も重要な特徴を示しています。 我々は我々のシミュレーションで観察された異なる相は、常にDMPCとコレステロール(の特定の混合物のためではないが、実験的に観察されている20、23、24)。 しかし,異なる実験研究は定性的に非常に異なる相図を示し,詳細な比較を行う可能性を制限する。 様々な相のスナップショットは、図に見つけることができます。 5.

図10に示すように、

5.

二層の側面図のスナップショット。 (A)T=3 7℃での1 0%コレステロールのLa相(B)T=3 7℃での4 0%コレステロールのL0相。 (C)T=20℃での5%コレステロールのリップル(P’β)相(D)T=5℃での5%コレステロールのL’β相(E)T=5℃での15%コレステロールのL’c相(F)T=5℃での40%コレステロールのLII相 尾の先端は灰色で描かれている。 コレステロールの頭部は黄色で、コレステロールの四量体のリングと尾のビーズは赤色で描かれています。 明確にするために、水ビーズは示されていない。 二重層の幅の違いは凝縮効果をうまく示している。非常に高い温度では、最大50モル%のコレステロールの添加は、膜の構造にほとんど影響を与えず、我々はすべての濃度(24)のためのLa相を観察します。

非常に高い温度では、最大50モル%のコレステロールの添加は、膜の構造にほとんど影響を与えず、我々はすべての濃度(24)のためのLa相を観察します。 Tp以下の温度では、コレステロールが脂質尾部の傾きを阻害することによってゲル相の構造を変化させ、L’c相の形成を引き起こすことを観察する(20)(図 Eとの5D)。 より高いコレステロール濃度(>20%)では、我々は小さな、コレステロールが豊富なクラスターの形成を観察する。 この相をLIIで示し、この相を図1 0に示す。 5E.TpとTmの間の温度では、純粋な二重層はリップル相にあり、コレステロールはこのリップル相を変換する(図参照)。 相(2 3)(図5C)に移行させる(図5C)。 5B)。 液体秩序相という用語は、Ipsenらによって導入された。 (25). 二重層の厚さは、液体の厚さとゲル相との間の中間である。 脂質テール秩序パラメータはゲル相に近い値を有するが,ゲル相とは対照的に脂質はより無秩序であり,傾斜しない。 コレステロールはL aからL Oへの相転移が起こる温度を徐々に上昇させる。 非常に高いコレステロール濃度では,温度がTm以下に低下すると液体秩序相はゲル相(LII)に変換する。 この段階は、ジパルミトイルホスファチジルコリン(26)のために実験的に観察されているが、我々はこれらの条件でDMPCの実験データを発見していません。 凝縮効果に戻りましょう。 図1.1.1. 図2は、凝縮効果が主遷移Tmのすぐ上の温度で最大であることを示しています。 その理由は、これらの条件では、純粋な二分子層は液体無秩序状態にあるのに対し、二分子層へのコレステロールの添加は、液体無秩序状態に比べてはるかに小さい脂質あたりの面積を有する液体秩序相に変換するからである。 この大きな違いは、大きな凝縮効果を引き起こす。 より高い温度で、液体段階は大いにより小さい凝縮の効果を与えるすべてのコレステロールの集中のために安定している残ります。 より低い温度では、純粋な脂質二重層は、液体秩序相の脂質あたりの面積にはるかに近い脂質あたりの面積を有し、その結果、凝縮効果ははるかに少ない。

上記の結果は、凝縮効果がコレステロールが誘導している相挙動の特定の変化の直接の結果であることを示している。 文献では、その凝縮効果に特異的に関与するコレステロール構造のそれらの側面についての様々な推測がある。 例えば、傘モデルは、リン脂質と比較して、コレステロールの親水性部分がはるかに小さく、水との相互作用からの追加のスクリーニングのために傘としてリン脂質を必要とするという概念に基づいている。 これは、追加の親水性基が特性を完全に変化させることを示唆している。 もう一つの重要な要因はかさばるリング構造です; 我々は尾で環を交換した場合、我々はより多くのアルコール分子(に似ている分子を得る27)。 しかし、疎水性の尾を短くすることはほとんど効果がありません。 図1.1.1. 1はこれらの変更をまねる変更されたコレステロールの分子を示します。 実際には、図中の結果は、図中の結果である。 3Bは、コレステロールの尾を短くすることが同じ凝縮効果を示すことを示す。 しかし、図1 4に示すように。 図3Bは、コレステロール分子の他の修飾の両方について、追加の親水性基を添加し、そして環を直鎖で置換することで、縮合効果が観察されないことを 私たちは反対の効果を観察します: これらの分子を添加することにより、理想的な混合と比較して二分子層がより拡大されるようになる。 分子あたりの面積に対する(より小さい)アルコールの効果は実験的に測定されており、実験データも増加を示している(28)。 これに密接に関連して、相図の両方の場合について、液相は全濃度範囲にわたって安定であることが観察された。 実際、これらの分子を添加すると主転移温度が低下するため、相図に大きな凝縮効果がある領域は存在しないことが観察されています。

コレステロールのこれらの構造変化を用いたシミュレーションは、メカニズムがどのように驚くほど微妙であることを示しています。 純粋な二分子層の主な遷移は疎水性相互作用に非常に敏感である。 脂質の頭部は水から疎水性の尾を選別する。 高温では、脂質あたりの面積は高く、このスクリーニングは最適ではありませんが、これらの条件では鎖エントロピーが支配的です。 温度を低下させることは、疎水性相互作用をスクリーニングすることがますます重要になり、主転移で最終的に鎖の秩序化を誘導する。 重要な側面は、コレステロールが液相をどのように不安定にするかを理解することです。 コレステロールは親水性の頭部が小さいため、疎水性相互作用を遮蔽するのに効率が悪い。 高温では、脂質二重層はこれを収容することができるが、より低い温度では、脂質は脂質あたりの面積を減少させることによってコレステロールのスクリー これは観測された順序付けを引き起こし、主遷移が増加する理由を説明します。 我々はコレステロール構造に導入された二つの変更は、その疎水性スクリーニングに影響を与えます; 両方の変形でコレステロールの本質的なundershieldingは消える。 これらの分子が二分子層に添加される場合、疎水性相互作用の追加的なスクリーニングの必要はなく、これらの分子は秩序相の形成を防止する。

私たちは凝縮効果を説明するために導入されている以前のモデルと私たちの観測を比較してみましょう。 まず,このモデルは超格子モデルで仮定されているように長距離秩序化の指示を与えない。 アンブレラモデルと凝縮複合体の両方に暗黙のうちにある種の局所組織の仮定がある。 例えば、傘モデルでは、1つの脂質分子が、1つまたは2つの隣接するコレステロール分子を選別することができると仮定される(例えば、参考文献1 1、1 2、1 3、1 4、1 5、1 6、1 7、1 8、 2). シミュレーションにより,これらの秩序構造を同定できないはるかに無秩序な構造を示した。 この時点で、我々のモデルには多くの仮定が含まれていることを思い出すことが重要であり、これは我々のシミュレーションから引き出された結論が実験シ 純粋に反発力を使用する粗粒モデルを使用することによって、このような豊かな位相挙動を得ることができたことに非常に驚いた。 このモデルは二分子層の構造に関する最近の実験データの非常に合理的な定量的記述を与える。 もう一つの興味深い点は,凝縮効果が主転移よりも狭い温度範囲で最大であることを計算で予測することである。 これを実験的に検証することは可能かもしれません。 このモデルの非常に厳格なテストは、実験相図との詳細な比較であったでしょう。 この文脈では、我々が発見した相が実験的に観察されていることは奨励されていますが、必ずしも正確にシミュレートされたシステムではありません。 シミュレーションに一致する実験データを慎重に選択することにより、非常に良い一致を主張することさえできます。 様々な実験間の不一致の可能性のある理由は、異なる技術が使用され、すべての技術が様々な相の構造の違いに等しく敏感であるわけではないというこ 相図と様々な相の構造に関する詳細な情報の組み合わせは、特定の実験技術が特定の相転移を識別できるかどうかについてのいくつかの指針を与

材料と方法

私たちのメソスコピックモデルは、散逸粒子動力学(DPD)(29)を用いて研究されました。 運動方程式は、時間ステップ0.03を短縮したvelocity Verletアルゴリズムの修正版を使用して統合されました。 標準的なDPDアルゴリズムの主な変更は,膜が張力のない状態でシミュレートされることを保証するために実装した方法である。 平均して1 5時間ステップの後、総体積が一定のままであるように脂質の面積を変化させる試みを含むモンテカルロステップを行った。 この動きの受け入れルールには、シミュレーションでゼロに設定された課された界面張力(15)が含まれます。 シミュレーション技術のさらなる詳細は、参照に記載されています。 15. 十分な水和を確保するために、我々は100,000コレステロールと脂質分子の合計4,000の水分子のシステムを使用しました。 コレステロール分子は、膜の両側でコレステロール分子の濃度が同じになるように、脂質分子をコレステロール分子によってランダムに置換することによ

謝辞

私たちは、議論を刺激してくれたJay Grovesと、私たちの原稿の重要な読書のためのDavid Chandler、George Oster、Jocelyn Rodgersに感謝します。

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