Eiwithydrolyse is een nuttige route naar de isolatie van individuele aminozuren. De voorbeelden omvatten cystine van hydrolyse van haar, tryptofaan van caseïne, histidine van rode bloedcellen, en arginine van gelatine.
veel voorkomende gehydrolyseerde producten die in levensmiddelen worden gebruikt, zijn gehydrolyseerde plantaardige eiwitten en gistextracten, die worden gebruikt als smaakversterkers omdat de hydrolyse van het eiwit vrij glutaminezuur oplevert. Sommige gehydrolyseerde runderproteïne poeders worden gebruikt voor gespecialiseerde diëten.
Eiwithydrolyse kan worden gebruikt om de allergene eigenschappen van volledige zuigelingenvoeding te wijzigen. Het verminderen van de grootte van koemelkeiwitten in de formule maakt het meer geschikt voor consumptie door baby ‘ s die lijden aan melkeiwitintolerantie. De Amerikaanse FDA heeft een label goedgekeurd voor dit gebruik van gedeeltelijk gehydrolyseerde eiwitten in 2017, maar een in hetzelfde jaar gepubliceerde meta-analyse toont onvoldoende bewijs voor dit gebruik.
gehydrolyseerd eiwit wordt ook gebruikt in bepaalde speciaal geformuleerde hypoallergene huisdierenvoer, met name hondenvoer voor honden en puppies die lijden aan allergieën veroorzaakt door bepaalde eiwittypen in standaard commerciële hondenvoermerken. De eiwitinhoud van het voedsel wordt opgesplitst in peptides die de waarschijnlijkheid voor het immuunsysteem van een dier het erkennen van een allergische bedreiging vermindert. Gehydrolyseerde eiwitdiëten voor katten worden vaak aanbevolen voor katten met voedselallergieën en bepaalde soorten spijsverteringsproblemen.