szkielet aminokwasowy
nazwa „aminokwas” pochodzi od faktu, że wszystkie aminokwasy zawierają zarówno grupę aminową, jak i grupę kwasu karboksylowego w swoim szkielecie. Istnieje 20 wspólnych aminokwasów obecnych w naturalnych białkach i każdy z nich zawiera ten sam kręgosłup. Szkielet, ignorując atomy wodoru, składa się ze wzoru:
N-C-c
patrząc na łańcuch aminokwasów, zawsze warto najpierw zorientować się, znajdując ten wzór szkieletu, zaczynając od końca N (aminowego końca pierwszego aminokwasu) do końca C (karboksylowego końca ostatniego aminokwasu).
tworzenie wiązania peptydowego jest reakcją syntezy odwodnienia. Grupa karboksylowa pierwszego aminokwasu jest połączona z grupą aminową drugiego przychodzącego aminokwasu. W tym procesie uwalniana jest cząsteczka wody i tworzy się wiązanie peptydowe.
spróbuj znaleźć kręgosłup w dipeptydzie powstałym w wyniku tej reakcji. Wzór, którego szukasz, to: N-C-C-n-c-c
przypisanie: Marc T. Facciotti (praca własna)
Sekwencja i liczba aminokwasów ostatecznie określają kształt, rozmiar i funkcję białka. Każdy aminokwas jest przyłączony do innego aminokwasu przez wiązanie kowalencyjne, znane jako wiązanie peptydowe, które powstaje w reakcji syntezy odwodnienia (kondensacji). Grupa karboksylowa jednego aminokwasu i grupa aminowa przychodzącego aminokwasu łączą się, uwalniając cząsteczkę wody i tworząc wiązanie peptydowe.