kapsyd białkowy stanowi drugie główne kryterium klasyfikacji wirusów. Kapsyd otacza wirusa i składa się ze skończonej liczby podjednostek białkowych znanych jako kapsomery, które zwykle wiążą się z kwasem nukleinowym wirionu lub znajdują się w jego pobliżu.
istnieją dwie główne klasy wirusów oparte na kapsydzie białkowym: (1) te, w których pojedyncza (lub segmentowana) liniowa cząsteczka kwasu nukleinowego z dwoma wolnymi końcami jest zasadniczo całkowicie wydłużona lub nieco zwinięta (helisa) i (2) te, w których kwas nukleinowy, który może lub nie musi być kowalencyjnie zamkniętym okręgiem, jest nawinięty szczelnie w skondensowaną konfigurację, jak kula przędzy. Te dwie klasy wirusów zakładają w pierwszym przypadku długą, wydłużoną strukturę rodopodobną, a w drugim przypadku symetryczny wielokąt.
zdecydowanie najlepiej zbadanym przykładem wirusa w kształcie walca jest wirus mozaiki tytoniu, który został skrystalizowany przez Wendella Stanleya w 1935 roku. Wirus mozaiki tytoniowej zawiera Genom jednoniciowego RNA zamkniętego przez 2130 cząsteczek pojedynczego białka; na każdy obrót helisy RNA przypada 161/3 cząsteczek białka w stosunku trzech nukleotydów dla każdej cząsteczki białka.
Encyclopædia Britannica, Inc.
w odpowiednich warunkach środowiskowych wirusowe cząsteczki RNA i białka w ciekłej zawiesinie zmontują się w doskonale uformowany i w pełni zakaźny wirus. Długość spiralnego kapsydu wirusa jest określona przez długość cząsteczki kwasu nukleinowego, która jest ramą dla montażu białka kapsydu. Różne wirusy spiralne mają różne długości i szerokości, w zależności od wielkości kwasu nukleinowego, a także od masy i kształtu cząsteczki białka. Niektóre z tych spiralnych wirusów tworzą sztywne pręty, podczas gdy inne tworzą elastyczne pręty, w zależności od właściwości zmontowanych białek.
poligonalne wirusy różnią się znacznie wielkością, od 20 do 150 nm średnicy, zasadniczo proporcjonalnie do wielkości cząsteczki kwasu nukleinowego zwiniętej w wirion. Większość, jeśli nie wszystkie, poligonalnych wirusów jest icosahedral; podobnie jak kopuła geodezyjna, są one utworzone przez trójkąty równoboczne, w tym przypadku 20. Każdy trójkąt składa się z podjednostek białkowych (kapsomerów), często w postaci heksonów (wielokrotności sześciu), które są budulcem kapsydu. Istnieje 12 wierzchołków (wierzchołkowe skrzyżowania tych 20 trójkątów), z których każdy zawiera penton (pięć podjednostek). Wiriony te mają trzy osie symetrii obrotowej pięciokrotnej, potrójnej i podwójnej. Liczba kapsomerów jest podstawą klasyfikacji taksonomicznej tych rodzin wirusów. Niektóre wirusy ikosahedryczne, zwykle te bardziej złożone, zawierają wewnętrzne białka przylegające do kwasu nukleinowego, które nie są dostępne na powierzchni wirionów.
Encyclopædia Britannica, Inc.