Po depolimeryzacji paraformaldehydu powstały formaldehyd może być stosowany jako fumigant, środek dezynfekujący, środek grzybobójczy i utrwalacz. Dłuższa długość łańcucha (wysoka masa cząsteczkowa) polioksymetyleny są stosowane jako termoplastyczne i są znane jako polioksymetylenowe tworzywo sztuczne (POM, Delrin). Był stosowany w przeszłości w zdyskredytowanej metodzie Sargenti leczenia kanałowego.
Paraformaldehyd nie jest utrwalaczem; musi być depolimeryzowany do formaldehydu w roztworze. W hodowli komórkowej typowa procedura utrwalania Formaldehydu obejmowałaby stosowanie 4% roztworu formaldehydu w buforowanej fosforanem soli fizjologicznej (PBS) na lodzie przez 10 minut. W preparatach histologicznych i patologicznych zazwyczaj etap utrwalania przeprowadza się przy użyciu 10% neutralnej buforowanej formaliny (4% formaldehydu) przez co najmniej 24 godziny.
Paraformaldehyd jest również używany do sieciowania białek do DNA, jak w chipie (immunoprecypitacja chromatyny), który jest techniką określania, która część DNA wiąże się z niektórymi białkami.
Paraformaldehyd może być stosowany jako substytut wodnego formaldehydu do produkcji żywicznego materiału wiążącego, który jest powszechnie stosowany wraz z melaminą, fenolem lub innymi środkami reaktywnymi w produkcji płyty wiórowej, płyty pilśniowej średniej gęstości i sklejki.