Musashi foi encomendado em Nagasaki, em 5 de agosto de 1942, e atribuído o 1º Navio de guerra da Divisão em conjunto com Yamato, Nagato, e Mutsu. Começando cinco dias depois, o navio conduziu testes de máquinas e aeronaves perto de Hashirajima. Seu armamento secundário de doze armas de 127 mm, 12 armas triplas de 25 mm, e quatro armas de 13,2 mm (0.52 in) metralhadoras antiaéreas foram equipadas a partir de 3-28 de setembro de 1942 em Kure, bem como um radar Tipo 21. O navio estava a trabalhar o resto do ano. Arima foi promovido a Contra-almirante em 1 de novembro.Musashi foi designado para a frota combinada, comandada pelo Almirante Isoroku Yamamoto, em 15 de janeiro de 1943 e navegou para Truk três dias depois, chegando em 22 de Janeiro. Em 11 de fevereiro, ela substituiu seu navio-irmã Yamato como navio-almirante da frota. Em 3 de abril, Yamamoto deixou Musashi e voou para Rabaul, Nova Bretanha para dirigir pessoalmente a “operação I-Go”, uma ofensiva aérea japonesa nas Ilhas Salomão. Suas ordens foram interceptadas e decifradas por Magic, e os caças americanos Lockheed P-38 Lightning abateram seu avião e o mataram na operação vingança, enquanto ele estava a caminho da Nova Grã-Bretanha para Ballale, Bougainville. Em 23 de abril, seus restos cremados foram levados de volta para Truk e colocados em sua cabine a bordo de Musashi.
Em 17 de Maio, em resposta a Americana ataques em Attu Island, Musashi—juntamente com a transportadora Hiyō, dois cruzadores pesados, e nove destróieres—sortied para o Pacífico norte. Quando nenhum contato foi feito com as forças americanas, os navios navegaram para Kure em 23 de maio, onde as cinzas de Yamamoto foram tiradas do navio em preparação para um funeral formal de Estado. Imediatamente depois, a força-tarefa de Musashi foi significativamente reforçada para contra-atacar as forças navais americanas ao largo de Attu, mas a ilha foi capturada antes que a força pudesse intervir. Em 9 de junho Arima foi substituído pelo Capitão Keizo Komura. Em 24 de junho, durante a revisão do Arsenal Naval de Yokosuka, Musashi foi visitado pelo Imperador Hirohito e oficiais navais de alto escalão. De 1 a 8 de julho, o navio foi equipado com um par de radares tipo 22 em Kure. Ela partiu para Truk em 30 de julho e chegou lá seis dias depois, onde ela retomou sua posição como capitânia da frota para o Almirante Mineichi Koga.em meados de outubro, em resposta a suspeitas de ataques americanos planejados na ilha Wake, Musashi liderou uma grande frota-três porta-aviões, seis navios de guerra e 11 cruzadores—para interceptar as forças americanas, mas não conseguiu estabelecer contato e retornou a Truk em 26 de outubro. Ela passou o resto de 1943 em Truk Lagoon. Komura foi promovido a Contra-almirante em 1 de novembro e transferido para a 3ª frota em 7 de dezembro como chefe de Estado-Maior, Capitão Bunji Asakura assumindo o comando de Musashi.
O navio permaneceu em Truk Lagoon até 10 de fevereiro de 1944, quando ela voltou para Yokosuka. Em 24 de fevereiro, Musashi navegou para Palau, carregando um batalhão do Exército Imperial Japonês e outro Das Forças Especiais de desembarque Naval e seu equipamento. Depois de perder a maior parte de sua carga de convés durante um tufão, ela chegou a Palau em 29 de fevereiro e permaneceu lá durante o mês seguinte. Em 29 de Março, Musashi partiu de Palau sob a cobertura da escuridão para evitar um ataque aéreo esperado, e encontrou o submarino USS Tunny, que disparou seis torpedos no couraçado; cinco deles falharam, mas o sexto fez um buraco de 5,8 metros de diâmetro perto da proa, inundando-a com 3000 toneladas de água. O ataque do torpedo matou sete tripulantes e feriu outros onze. Depois de reparos temporários, Musashi navegou para o Japão mais tarde naquela noite e chegou ao Arsenal Naval de Kure em 3 de abril. De 10 a 22 de abril, ela foi reparada, enquanto seu armamento antiaéreo foi substancialmente aumentado no espaço liberado pela remoção das torres triplas montadas em feixes de 6,1 polegadas (155 mm). Quando ela se desarmou em 22 de abril, a bateria secundária do navio era composta por seis metralhadoras de 15,5 cm, vinte e quatro metralhadoras de 12,7 cm, cento e trinta canhões de 25 mm e quatro metralhadoras de 13,2 mm. Ela também recebeu novos radares (que ainda eram primitivos em comparação com os equipamentos americanos), e trilhos de carga de profundidade foram instalados em seu fantail.em maio de 1944, Asakura foi promovido a Contra-almirante e Musashi partiu de Kure para Okinawa em 10 de maio, depois para Tawi-Tawi em 12 de Maio. Ela foi designada para a primeira frota móvel, sob o comando do Vice-Almirante Jisaburo Ozawa, com sua irmã. Em 10 de junho, os couraçados partiram Tawi-Tawi para Batjan sob o comando do Vice-Almirante Matome Ugaki, em preparação para a operação Kon, um contra-ataque planejado contra a invasão americana de Biak. Dois dias depois, quando chegou a notícia de ataques americanos em Saipan, sua força foi desviada para as Ilhas Marianas. Depois de se encontrarem com a força principal de Ozawa em 16 de junho, os couraçados foram designados para a 2ª Frota do Vice-Almirante Takeo Kurita. Durante a batalha do Mar das Filipinas, Musashi não foi atacado. Após a desastrosa derrota do Japão na batalha, a segunda frota retornou ao Japão. Em 8 de julho, Musashi e sua irmã embarcaram 3.522 homens e equipamentos do 106º Regimento de Infantaria do Exército da 49ª Divisão de infantaria e navegaram para a Ilha Lingga, onde chegaram em 17 de julho.Batalha do Golfo de Leyte: Batalha do Golfo de Leyte
o Capitão Toshihira Inoguchi aliviado Asakura no comando de Musashi em 12 de agosto de 1944, e foi promovido a contra-almirante em 15 de outubro. Três dias depois, ela navegou para a Baía de Brunei, Bornéu, para se juntar à frota japonesa principal em preparação para a “operação Sho-1”, o contra-ataque planejado contra os desembarques americanos em Leyte. O plano Japonês exigia que as forças portadoras de Ozawa atraíssem as frotas norte-americanas ao norte de Leyte para que a primeira força de desvio de Kurita (também conhecida como força Central) pudesse entrar no Golfo de Leyte e destruir as forças americanas que desembarcavam na ilha. Musashi, juntamente com o resto da força de Kurita, partiu de Brunei Para As Filipinas em 22 de outubro.no dia seguinte, O submarino USS Dace torpedeou e afundou o cruzador pesado Maya perto de Palawan. O contratorpedeiro Akishimo resgatou 769 sobreviventes e os transferiu para Musashi no final do dia.
perda no Mar de Sibuyan
em 24 de outubro, enquanto transitava pelo mar de Sibuyan, os navios de Kurita foram avistados por uma aeronave de reconhecimento do porta-aviões USS Intrepid. Pouco mais de duas horas depois, o couraçado foi atacado por oito Curtiss SB2C bombardeiros Helldiver de Intrepid às 10:27. Uma bomba de 230 kg atingiu o telhado da Torre nº1, não penetrando. Dois minutos depois, Musashi foi atingido a estibordo por um torpedo de um vingador Grumman TBF, também da Intrepid. O navio levou 3.000 toneladas longas (3.000 t) de água e um 5.Uma lista de 5 graus a estibordo, que mais tarde foi reduzida a 1 grau por meio de compartimentos de contrapeso no lado oposto. Durante este ataque, dois Avengers foram abatidos.uma hora e meia depois, outros oito Helldivers da Intrepid atacaram novamente Musashi. Uma bomba atingiu o deck superior e não conseguiu detonar; outra atingiu o lado bombordo do deck e penetrou dois decks antes de explodir acima de uma das salas de máquinas. Fragmentos quebraram um tubo de vapor na sala das máquinas e forçaram o seu abandono, bem como o da sala da caldeira adjacente. A potência foi perdida para o eixo da hélice de bombordo e a velocidade do navio caiu para 22 nós (41 km/h; 25 mph). Fogo antiaéreo abateu dois Helldivers durante este ataque. Três minutos depois, nove Avengers atacaram de ambos os lados da nave, marcando três ataques de torpedos no lado bombordo. Um atingiu a torre No. 1, o segundo inundou uma sala de máquinas hidráulicas forçando as torres principais a mudar para bombas hidráulicas auxiliares, e o terceiro inundou outra sala de máquinas. Mais rebatidas reduziram a lista a um grau a bombordo, mas o grau de enchente reduziu o freeboard para a frente em 1,8 metros. Durante este ataque, Musashi disparou projéteis antiaéreos sanshikidan de seu armamento principal; uma bala detonou na Arma do meio da torre No. 1, possivelmente por causa de um fragmento de bomba no barril, e destruiu a maquinaria elevadora da torre.
Em 13:31, O navio foi atacado por 29 aeronaves dos porta-aviões Essex e Lexington. Dois Grumman F6F Hellcat afundaram o convés do navio e os Helldivers marcaram mais quatro ataques de bomba perto das suas torres dianteiras. Musashi foi atingido por mais quatro torpedos, três dos quais estavam à frente da torre No. 1, causando extensas enchentes. O navio estava agora listando um grau a estibordo, e tinha tomado tanta água que sua proa estava agora em 13 pés (4,0 m) e sua velocidade tinha sido reduzida para 20 nós (37 km/h; 23 mph). Duas horas depois, nove Helldivers da Enterprise atacaram com bombas blindadas de 450 kg, marcando quatro rebatidas. O navio foi atingido por mais três torpedos, abrindo sua proa de estibordo e reduzindo sua velocidade para 13 Nós (24 km/h; 15 mph). Às 15:25, Musashi foi atacado por 37 aeronaves da Intrepid, o porta-aviões Franklin e Cabot. A nave foi atingida por 13 bombas e mais 11 torpedos durante este ataque pela perda de três Avengers e três Helldivers. Sua velocidade foi reduzida para 6 Nós (11 km/h; 6.Seu motor principal de direção foi temporariamente nocauteado e seu Leme foi brevemente encravado 15 graus a bombordo. Counterflooding reduziu sua lista para seis graus a bombordo de seu máximo anterior de dez graus. Musashi tinha sido atingido por um total estimado de 19 torpedos e 17 bombas.Kurita deixou Musashi para cuidar de si mesma às 15:30, e encontrou-a novamente às 16:21 depois de reverter o curso. O navio dirigia-se para norte, com uma lista de 10 graus a bombordo, descendo 7,9 metros na proa, com o seu proa inundado. Ele detalhou um cruzador pesado e dois contratorpedeiros para escoltá-la enquanto esforços frenéticos foram feitos para corrigir sua lista, incluindo inundar outra sala de máquinas e algumas caldeiras. Os motores pararam antes de poder ser atracada. Às 19: 15, sua lista chegou a 12 graus e sua tripulação foi ordenada a se preparar para abandonar o navio, o que eles fizeram quinze minutos depois, quando a lista chegou a 30 graus. Musashi virou às 19: 36 e afundou em 4,430 pés (1,350 m) a 13 ° 07’N 122 ° 32’E / 13.117°N 122.533°ECoordinates: 13 ° 07’N 122 ° 32’E / 13.117°N 122.533 ° E. Inoguchi escolheu afundar com seu navio; 1.376 de sua tripulação de 2.399 homens foram resgatados. Cerca de metade de seus sobreviventes foram evacuados para o Japão, e o resto participou da defesa das Filipinas. O destruidor Shimakaze resgatou 635 dos sobreviventes de Maya de Musashi.