Uma vez que o paraformaldeído é despolimerizado, o formaldeído resultante pode ser usado como fumigante, desinfectante, fungicida e fixativo. Polioximetilenos de cadeia longa (peso molecular elevado) são usados como termoplásticos e são conhecidos como plásticos de polioximetileno (POM, Delrin). Foi usado no passado no desacreditado método Sargenti de tratamento de canal de raiz.
O Paraformaldeído não é um fixador; deve ser despolimerizado a formaldeído EM solução. Na cultura celular, um procedimento típico de fixação de formaldeído envolveria a utilização de uma solução de formaldeído de 4% em solução salina tampão fosfato (PBS) no gelo durante 10 minutos. Na preparação de amostras de Histologia e patologia, geralmente, o passo de fixação é realizado utilizando formalina Tampão de 10% (4% de formaldeído) durante, pelo menos, 24 horas.
O Paraformaldeído também é usado para cruzar proteínas para o DNA, como usado no ChIP (imunoprecipitação cromatina), que é uma técnica para determinar a que parte do DNA certas proteínas estão se ligando.o Paraformaldeído pode ser utilizado como substituto do formaldeído aquoso para produzir o material de ligação resinoso, que é frequentemente utilizado juntamente com melamina, fenol ou outros agentes reactivos no fabrico de painéis de partículas, painéis de fibras de média densidade e contraplacado.