hormonbehandling
penisens tillväxt både före födseln och under barndomen och puberteten påverkas starkt av testosteron och i mindre grad tillväxthormonet. Senare endogena hormoner har emellertid huvudsakligen värde vid behandling av mikropenis orsakad av hormonbrister, såsom hypopituitarism eller hypogonadism.
oavsett orsaken till mikropenis, om det är erkänt i spädbarn, föreskrivs ofta en kort kurs av testosteron (vanligtvis inte mer än 3 månader). Detta inducerar vanligtvis en liten mängd tillväxt, vilket bekräftar sannolikheten för ytterligare tillväxt vid puberteten, men uppnår sällan normal storlek. Inget ytterligare testosteron ges under barndomen för att undvika oönskad virilisering och benmognad. (Det finns också några bevis för att för tidig administrering av testosteron kan leda till minskad penisstorlek hos vuxna.)
testosteronbehandling återupptas i ungdomar endast för pojkar med hypogonadism. Penistillväxt slutförs i slutet av puberteten, liknar slutförandet av höjdtillväxt, och tillhandahållande av extra testosteron till vuxna efter puberteten ger liten eller ingen ytterligare tillväxt.
kirurgi
eftersom hormonbehandling sällan uppnår medelstorlek har flera kirurgiska tekniker som liknar fallplastik för penisförstoring utformats och utförts; men de anses inte allmänt vara framgångsrika nog att bli allmänt antagna och utförs sällan i barndomen.
i extrema fall av mikropenis finns det knappt någon axel, och glansen verkar sitta nästan på skamhuden. Från 1960-talet till slutet av 1970-talet var det vanligt att könsfördelning och operation rekommenderades. Detta var särskilt troligt om bevis tyder på att svaret på ytterligare testosteron och pubertal testosteron skulle vara dåligt. Med föräldraacceptans skulle pojken omfördelas och döpas om till en tjej, och kirurgi utfördes för att ta bort testiklarna och konstruera en konstgjord vagina. Detta baserades på den nu ifrågasatta tanken att könsidentitet helt och hållet formades av socialisering, och att en man med en liten penis inte kan hitta någon acceptabel plats i samhället.Johns Hopkins Hospital, Det centrum som är mest känt för detta tillvägagångssätt, utförde tolv sådana Omplaceringar från 1960 till 1980, särskilt David Reimer (vars penis förstördes av en omskärelseolycka), övervakad av John Money. I mitten av 1990-talet erbjöds omplacering mindre ofta och alla tre lokalerna hade utmanats. Tidigare ämnen av sådan operation, vokal om deras missnöje med det vuxna resultatet, spelade en stor roll för att avskräcka denna praxis. Sexuell omplacering utförs sällan idag för svåra mikropenis (även om frågan om att höja pojken som en tjej ibland fortfarande diskuteras.) (Se ”History of intersex surgery” för en mer omfattande diskussion.)