aminohapon selkäranka
nimi ”aminohappo” on johdettu siitä, että kaikki aminohapot sisältävät selkärangassaan sekä aminoryhmän että karboksyylihapporyhmän. Luonnon proteiineissa on 20 yhteistä aminohappoa, ja jokainen niistä sisältää saman selkärangan. Vetyatomeista piittaamatta oleva selkäranka koostuu kaavasta:
n-C-c
aminohappoketjua tarkasteltaessa on aina hyödyllistä ensin suunnata itsensä löytämällä tämä selkärankakuvio, joka alkaa N-terminuksesta (ensimmäisen aminohapon aminopäästä) C-terminukseen (viimeisen aminohapon karboksyylihappopäästä).
peptidisidoksen muodostuminen on dehydraatiosynteesireaktio. Ensimmäisen aminohapon karboksyyliryhmä liittyy toisen saapuvan aminohapon aminoryhmään. Prosessissa vapautuu vesimolekyyli ja muodostuu peptidisidos.
yritä löytää selkäranka tästä reaktiosta muodostuneesta dipeptidistä. Etsimäsi kuvio on: N-C-C-n-c-c
Attribution: Marc T. Facciotti (Oma teos)
aminohappojen järjestys ja lukumäärä määräävät lopulta proteiinin muodon, koon ja toiminnan. Kukin aminohappo on kiinnittynyt toiseen aminohappoon kovalenttisella sidoksella eli peptidisidoksella, joka muodostuu dehydraatiosynteesi-eli kondensaatioreaktiolla. Yhden aminohapon karboksyyliryhmä ja saapuvan aminohapon aminoryhmä yhdistyvät, jolloin vapautuu vesimolekyyli ja syntyy peptidisidos.