proteiinikapsidi on toinen tärkeä kriteeri virusten luokittelussa. Kapsidi ympäröi virusta ja koostuu äärellisestä määrästä kapsomeereiksi kutsuttuja proteiinialayksiköitä, jotka yleensä liittyvät virionin nukleiinihappoon tai löytyvät sen läheisyydestä.
proteiinikapsidiin pohjautuvia viruksia on kaksi pääluokkaa: 1) ne, joissa yksittäinen (tai segmentoitu) lineaarinen nukleiinihappomolekyyli, jossa on kaksi vapaata päätä, on olennaisesti kokonaan laajentunut tai jokseenkin kietoutunut (helix), ja 2) ne, joissa nukleiinihappo, joka voi olla tai ei ole kovalenttisesti suljettu ympyrä, kiedotaan tiiviisti tiivistettyyn muotoon lankakerän tavoin. Nämä kaksi virusluokkaa olettavat ensimmäisessä tapauksessa pitkän, pidennetyn sauvamaisen rakenteen ja toisessa tapauksessa symmetrisen monikulmion.
ylivoimaisesti parhaiten tutkittu esimerkki kierteisestä sauvanmuotoisesta viruksesta on tupakan mosaiikkivirus, jonka Wendell Stanley kiteytti vuonna 1935. Tupakan mosaiikkivirus sisältää genomin yksijuosteisesta RNA: sta, jota ympäröi 2 130 molekyyliä yhdestä proteiinista; jokaista RNA-helixin kierrosta kohden on 161/3 proteiinimolekyyliä suhteessa kolme nukleotidia jokaista proteiinimolekyyliä kohti.
Encyclopædia Britannica, Inc.
oikeissa ympäristöolosuhteissa nestemäisessä suspensiossa olevat virus-RNA-ja proteiinimolekyylit kasautuvat täydellisesti muodostuneeksi ja täysin tarttuvaksi virukseksi. Kierteisen viruksen kapsidin pituus määräytyy nukleiinihappomolekyylin pituuden mukaan, joka toimii kapsidiproteiinin kokoamiskehyksenä. Eri kierteisillä viruksilla on eri pituudet ja leveydet riippuen nukleiinihapon koosta sekä proteiinimolekyylin massasta ja muodosta. Jotkut näistä kierteisistä viruksista muodostavat jäykkiä sauvoja, kun taas toiset muodostavat joustavia sauvoja riippuen koottujen proteiinien ominaisuuksista.
monikulmaisten virusten koko vaihtelee suuresti, läpimitaltaan 20-150 nm, mikä on olennaisesti verrannollinen virionin sisään kietoutuneen nukleiinihappomolekyylin kokoon. Monikulmion viruksista useimmat, ellei kaikki, ovat ikosaedrisiä; geodeettisen kupolin tavoin ne muodostuvat tasasivuisista kolmioista, tässä tapauksessa 20. Jokainen kolmio koostuu proteiinialayksiköistä (kapsomeereista), usein heksoneina (kuuden kerrannaisina), jotka ovat kapsidin rakennuspalikoita. On 12 vertices (apical liitokset näiden 20 kolmiot), joista jokainen koostuu pentoni (viisi alayksikköä). Näillä ikosaedrisillä virioneilla on kolme akselia, jotka ovat viisiosaisia, kolmiosaisia ja kaksiosaisia rotaatiosymmetrisiä. Kapsomeerien lukumäärä on näiden virussukujen taksonomisen luokittelun perusta. Eräät ikosaedriset virukset, yleensä monimutkaisemmat, sisältävät nukleiinihappoon kiinnittyneitä sisäisiä proteiineja, joihin virionien pinnalla ei pääse käsiksi.
Encyclopædia Britannica, Inc.