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Cilié, ou ciliophore, tout membre du phylum des protozoaires Ciliophora, dont il existe environ 8 000 espèces; les ciliés sont généralement considérés comme les protozoaires les plus évolués et les plus complexes des protozoaires. Les ciliés sont des organismes unicellulaires qui, à un certain stade de leur cycle de vie, possèdent des cils, des organites ressemblant à des cheveux courts utilisés pour la locomotion et la collecte de nourriture.
Les cils sont généralement disposés en rangées, appelées cinéties, sur la pellicule (revêtement cellulaire), mais ils peuvent fusionner près du cytostome (bouche cellulaire) de certaines espèces pour former des membranelles ou des membranes ondulées (divers groupements de cils en forme de feuille ou d’éventail); ailleurs sur la pellicule, les cils peuvent former des touffes limbiques appelées cirri. La plupart des ciliés ont une pellicule flexible et des vacuoles contractiles, et beaucoup contiennent des toxicystes ou d’autres trichocystes, de petits organites avec des structures en forme de fil ou d’épine qui peuvent être déchargés pour l’ancrage, la défense ou pour capturer des proies.
Les ciliés ont un ou plusieurs macronoyaux et de un à plusieurs micronoyaux. Les macronoyaux contrôlent les fonctions métaboliques et développementales ; les micronoyaux sont nécessaires à la reproduction.
La reproduction est généralement asexuée, bien que des échanges sexuels se produisent également. La réplication asexuée se fait généralement par fission binaire transverse ou par bourgeonnement (q. v.). Les phénomènes sexuels comprennent la conjugaison (échange génétique entre individus) et l’autogamie (réorganisation nucléaire au sein d’un individu). La reproduction sexuée n’entraîne pas toujours une augmentation immédiate du nombre; cependant, la conjugaison est souvent suivie d’une fission binaire.
Bien que la plupart des ciliés vivent librement et soient aquatiques, comme le Paramécie (q. v.), beaucoup sont des ectocommensaux, vivant sans danger sur les branchies ou le tégument des invertébrés, et certains, comme le Balantidium (q. v.), responsable de la dysenterie, sont parasitaires. Pour plus d’informations sur les ciliés représentatifs, voir peritrich; spirotrich; suctorien.