大学院生として、生物学のラボを教えることは私の週の定期的な部分であり、私がほとんどの四半期を教えるラボは系統発生と生物多様性に 最近では、私の学生、仲間のTAs、そしてクラスを担当するスタッフや教授と系統発生用語について議論しています。 用語は、多くの場合、系統発生学で混乱を取得し、言葉は時々異なる人々によって異なるものを意味するために使用されます。 これらの用語をさらに混乱させる側面の1つは、それらが相互に排他的ではなく、議論されているグループに依存するため、例えば、形質は検討されているグループに応じてsynapomorphyとautapomorphy（下記参照）の両方になる可能性があるということです。 だから、私自身の心の中で物事をクリアし、うまくいけばそれらをより効果的に教えることができるようにしようとすると、ここでは定義と説明を付
Apomprphy–派生した文字の状態。 これは進化のlinageに沿う革新の何でもである。 だから、先祖の性格の状態とは異なるものは何でも。 例えば、脊索動物門の中では、脊索動物の進化の初期に分岐した系統が持たず、脊椎動物のクラスでは新しいものである脊柱の進化は、apomorphyになります。
Synapomorphy–共有された派生した文字の状態。 これは二つの分類群が共有するapomorphyであり、それはそれら二つの分類群の共通の祖先に存在していたと仮定されています。 一例は鳥の羽です。 すべての鳥は羽を持っており、すべての鳥に共通の祖先が羽を持っていて、その特性を世代を経て継承しているため、羽を持っていると考えられています。
Plesiomorphy–先祖の文字の状態。 これは、グループの祖先から継承された任意の特性です。 例えば、爬虫類は発熱性であり、一定の内部体温を維持しない。 彼らはすべての爬虫類の祖先が発熱していたので、この特徴を持っています。 これは、最初の爬虫類のいくつかの子孫が発熱性ではない（鳥類は吸熱性である）ため、シナプス形態とは異なる。 言い換えれば、この特性は先祖であるが、その祖先のすべてではなく、いくつかによって共有されている。
Symplesiomorphy–共有された先祖の文字の状態。 これは、グループの祖先から継承され、複数の子孫の系統に渡された任意の特性です。 Plesiomorphyの例を続けていくために、ワニとカメは両方とも発熱しているという事実が、
Autapomorphy–特定の分類群に固有の派生形質。 これらは、1つのグループだけが特定の特性を持つため、グループがどのように関連しているかを決定するのには有用ではありません。 しかし、これらは分類群を識別するのに非常に有用である。 例えば、羽は鳥にのみ発生します。 これにより、クラスAvesの文字”羽”と自己形態が作成されます。 “Feathers”という文字は、Avesクラス内の分類群のsynapomorphyでもあります。 猛禽類と鳴禽類の両方が羽を持っており、彼らは共通の祖先からそれらを継承しました。
オープン円=先祖の文字の状態、塗りつぶされた円=派生文字の状態。
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