som doktorand är undervisning i biologilaboratorier en vanlig del av min Vecka och labbet som jag undervisar de flesta kvartaler handlar om fylogenetik och biologisk mångfald. Nyligen har jag haft diskussioner om fylogenetiska termer med mina elever, kolleger TAs, och personal och professorer som ansvarar för klassen. Terminologi blir ofta förvirrande i fylogenetik, och ord används ibland för att betyda olika saker av olika människor. En av de aspekter som gör dessa termer extra förvirrande är att de inte utesluter varandra och beror på de grupper som diskuteras, så till exempel kan ett drag vara både en synapomorfi och en autapomorfi (se nedan) beroende på vilka grupper som undersöks. Så, i ett försök att rensa upp saker i mitt eget sinne, och så förhoppningsvis kunna lära dem mer effektivt, här är några vanliga termer i kladistik med tillhörande definitioner och förklaringar.
Apomprphy-ett härledt teckentillstånd. Detta är allt som är en innovation längs en evolutionär linje. Så allt som skiljer sig från förfädernas karaktärstillstånd. Till exempel, inom phylum Chordata, skulle utvecklingen av en ryggrad, vilket är något linjer som förgrenade sig tidigare i Ackordutveckling inte ha och så är nytt i klassen Vertebrata, vara en apomorfi.
Synapomorphy-ett delat, härlett teckentillstånd. Detta är en apomorfi som två taxa delar och som antas ha varit närvarande i den gemensamma förfadern till dessa två taxa. Ett exempel skulle vara fjädrar i fåglar. Alla fåglar har fjädrar, och det antas att de har fjädrar eftersom den gemensamma förfadern till alla fåglar hade fjädrar och passerade den egenskapen ner genom generationerna.
Plesiomorphy-ett förfäderskaraktärstillstånd. Detta är något drag som ärvdes från en grupps förfader. Reptiler är till exempel exoterma, de upprätthåller inte en konstant inre kroppstemperatur. De har denna egenskap eftersom förfäderna till alla reptiler var exoterma. Detta skiljer sig från en synapomorfi eftersom vissa ättlingar till de första reptilerna inte är exoterma (fåglar är endoterma). Med andra ord, detta drag är förfäder, men delas av vissa, men inte alla, av dessa förfäder; Ättlingar.
Symplesiomorphy-en delad, förfäders karaktär tillstånd. Detta är något drag som ärvdes från förfäderna till en grupp och har överförts till mer än en ättling. Att fortsätta med exemplet för en plesiomorphy, det faktum att krokodiler och sköldpaddor är båda exoterma, men
Autapomorphy – ett härledt drag som är unikt för en viss taxa. Dessa är inte användbara för att bestämma hur grupper är relaterade eftersom endast en grupp kommer att ha den särskilda egenskapen. Dessa är dock extremt användbara för att identifiera taxa. Till exempel förekommer fjädrar endast hos fåglar. Detta gör karaktären” fjädrar ” och autapomorphy för klass Aves. Karaktären” fjädrar ” är också en synapomorfi för taxa inom klass Aves. Rovfåglar och sångfåglar har båda fjädrar och de ärvde dem från en gemensam förfader.
öppna cirklar = ancestral character state, fyllda cirklar = härledd character state.
Läs hela inlägget ”