Aminosyrebygningen
navnet «aminosyre» er avledet fra det faktum at alle aminosyrer inneholder både en aminogruppe og karboksylsyregruppe i ryggraden. Det er 20 vanlige aminosyrer tilstede i naturlige proteiner, og hver av disse inneholder samme ryggrad. Ryggraden, når du ignorerer hydrogenatomer, består av mønsteret:Når du ser på en kjede av aminosyrer, er det alltid nyttig å først orientere deg ved å finne dette ryggradsmønsteret fra N-terminalen (aminoenden av den første aminosyren) Til C-terminalen (karboksylsyreenden av den siste aminosyren).
Peptidbindingsdannelse er en dehydreringssyntesereaksjon. Karboksylgruppen av den første aminosyren er knyttet til aminogruppen av den andre innkommende aminosyren. I prosessen frigjøres et molekyl av vann og en peptidbinding dannes.
Prøv å finne ryggraden i dipeptidet dannet fra denne reaksjonen. Mønsteret du leter etter er: N-C-C-N-C-c
Attribution: Marc T. Facciotti (eget arbeid)
sekvensen og antall aminosyrer bestemmer til slutt proteinets form, størrelse og funksjon. Hver aminosyre er festet til en annen aminosyre ved en kovalent binding, kjent som en peptidbinding, som dannes ved en dehydreringssyntese (kondensasjons) reaksjon. Karboksylgruppen av en aminosyre og aminogruppen av den innkommende aminosyren kombinerer, frigjør et molekyl vann og skaper peptidbindingen.