Forskere ved Harvard University har samlet det første nesten komplette genomet av den lille bush moa, en flygeløs fugl som ble utryddet kort tid Etter At Polyneserne bosatte New Zealand i slutten av det 13.århundre. Oppnåelsen beveger feltet av utdøde genomer nærmere målet om «de-utryddelse»—å bringe forsvunnede arter tilbake til livet ved å glide genomet inn i egget til en levende art, «Jurassic Park» – lignende.»Sannsynligheten for utryddelse øker med hver forbedring i gammel DNA-analyse,» Sa Stewart Brand, medstifter av nonprofit conservation group Revive and Restore, som har som mål å gjenopplive forsvunnede arter, inkludert passasjerduven og ullmammuten, hvis genomer allerede er mest satt sammen.
for moa, HVIS DNA ble rekonstruert fra tåbenet til et museumsprøve, kan det kreve litt mer genetisk tinkering og mye egg: den 6-tommers lange, 1-punds som emus lå, kan være bare billetten.
arbeidet med little bush moa har ennå ikke blitt publisert i en journal (forskerne postet et ikke-peer-reviewed papir på et offentlig nettsted), men kolleger i den lille verden av utdøde genomer sang sin ros. Morten Erik Allentoft Fra Naturhistorisk Museum i Danmark, en ekspert på moa DNA og andre utdødde genomer, kalte det » et betydelig skritt fremover. Beth Shapiro fra University Of California, Santa Cruz, som ledet en 2017-studie som rekonstruerte genomet til passasjerduven, kalte det «superkult» fordi det » gir oss et utdødt genom på en evolusjonær gren der vi ikke hadde hatt noen før.»
at samlingen av et utdødt genom blir spredt som vitenskapelig samizdat, er ikke uvanlig på dette feltet. Tidsskrifter krever mer fra papirer enn «her er det,» Sa Ben Novak, medforfatter av passenger pigeon study. «Tallet som faktisk er gjort er muligens firedoblet» de fire eller fem utdøde genomene rapporterte formelt, » men resultatene sitter bare i folks laboratorier.»
de nesten fullstendige utdødde genomene inkluderer To menneskelige slektninger, Neandertalerne Og Denisovanerne, i tillegg til ullmammuten og passasjerduen. Den zebra-lignende quagga var den første utdøde arten som hadde SITT DNA sekvensert, tilbake i den genomiske Steinalderen i 1984, men det er ikke opp til moderne standarder.Forskere er også nær å rekonstruere genomene til dodo, den flygeløse fuglen som ble utryddet fra Mauritius, det eneste hjemmet, på slutten av 1600-tallet; og great auk, som bodde I Nord-Atlanteren før de døde ut i midten av det 19.århundre. I forrige måned avslørte forskere I Australia genomet Til Den Tasmanske tigeren, den siste som døde i fangenskap i 1936.
i hvert tilfelle var trinnene like. Forskere samler vevsprøver fra museumseksempler: Museene Victoria I Melbourne, Australia, hadde store Tasmanske tigre, for eksempel, Mens Royal Ontario Museum I Toronto hadde en fin tå bein fra den lille bush moa. De trekker DERETTER UT DNA. Det er nesten alltid så dårlig fragmentert som en knust vinboble fordi «DNA-forfall begynner innen dager etter døden,» sa UCSCS Shapiro.
Heldigvis er Det Ikke et problem. Dagens high-throughput genome sequencers faktisk fungerer best PÅ DNA måle score til hundrevis av nukleotider-den ikoniske A, T, C, Og G ‘ som omfatter DNA-lang.
den vanskelige delen er å finne ut hvor brikkene hører hjemme på genomet: på hvilke kromosomer og i hvilken rekkefølge. For å gjøre Det tok Harvards Alison Cloutier og resten av little bush moa-teamet (som nektet å snakke om arbeidet før den formelle publikasjonen) sine 900 millioner nukleotider, spredt over millioner AV DNA-stykker, og prøvde å matche dem til bestemte steder på genomet av emu, en nær slektning til alle ni moa-arter.
Som gjorde det mulig for forskerne å få omtrent 85 prosent av genomet på rett sted. «De andre 15 prosentene er i deres data, men er vanskelig å organisere ved hjelp av emu-genomet,» Sa Novak. Å slå små biter AV DNA inn i et komplett genom » har vært ekstraordinært vanskelig. Det faktum at de kunne få et genom fra et lite bush moa toe bein er en stor avtale, siden nå kan vi kanskje bruke dataene til å gjøre andre utdøde fuglearter.»
det er fordi fuglgenomer, inkludert de åtte andre (alle utdøde) moa-artene, har lignende strukturer. Det vil si at gener for bestemte egenskaper har en tendens til å være på samme kromosom og ordnet i forhold til andre gener på en lignende måte. Jo flere ledetråder til hvordan man organiserer biter av genom som en sequencer spytter ut, desto bedre.
for passasjerduen brukte Shapiro og hennes paleogenomics-team genomet til band-tailedduen for å finne ut hvordan de skulle organisere sine korte DNA-sekvenser. Hun prøver å gjøre noe lignende for dodoen, ved hjelp av genomet av nicobarduen (nærmeste levende art) som en mal.Det er «ekstremt vanskelig» å få genomorganisasjonen riktig, Sa Charlie Feigin, en postdoktor ved Princeton University som ledet sekvenseringen av Det Tasmanske tigergenomet. «Du kan se på nært beslektede arter for ledetråder,» men uten garanti for å få det utdøde genomet ordnet riktig. «Den strukturen betyr noe, men i hvilken grad den må være perfekt, diskuteres.»for mammoth project, for eksempel, sekvenserer forskere elefantkromosomer for å få en bedre følelse av hvordan mammut DNA er organisert, sa Harvards George Church, som leder prosjektet. De håper også å forbedre naturen, genetisk engineering motstand mot herpesviruset i mammutgenomet (jo bedre å holde det i live bør de-utryddelsesarbeid). Noen forskere mener at herpesinfeksjoner bidro til å drepe mammuten. Kirken sa hans lab har som mål å kunngjøre fremgang på begge fronter i år.Den beste gjetningen er at hvis forskere oppsto en utdødt art ved å sette sitt reassembled genom inn i egget til en levende art, ville det sannsynligvis ikke være en perfekt kopi av originalen. En» de-utdødd » passasjer due kan spise hva den opprinnelige gjorde, men har ulike reproduktive og sosiale atferd, for eksempel.
putting-into-an-egg-trinnet viser seg å være vanskeligere hos fugler enn pattedyr. Et rekonstruert genom kan innføres i et pattedyrsegg med kloningsteknikken som produserte Dolly sauen. Men det virker ikke hos fugler- «i hvert fall så langt,» sa Brand. Et håp er å få en løsning som nylig lyktes i kyllinger, i utgangspunktet å sette genomet i embryoceller som blir egg eller sæd, for å lykkes i ville fugler.
Det er «En Av tingene Revive and Restore er fokusert på nå,» Sa Brand. «De-utryddelse kommer, gradvis og sikkert. Det vil til slutt bli sett på som bare en annen form for gjeninnføring, «som å bringe» ulver tilbake til Yellowstone Park bever tilbake Til Sverige og Skottland.»
Publiseres Med tillatelse FRA STAT. Denne artikkelen opprinnelig dukket opp 27. februar 2018