proteinet kapsid gir det andre hovedkriteriet for klassifisering av virus. Kapsidet omgir viruset og består av et begrenset antall proteinunderenheter kjent som kapsomerer, som vanligvis forbinder med, eller finnes nær, virionnukleinsyren.
det er to hovedklasser av virus basert på proteinkapsidet: (1) de der et enkelt (eller segmentert) lineært nukleinsyremolekyl med to frie ender er i det vesentlige helt utvidet eller noe viklet (en helix) og (2) de der nukleinsyren, som kanskje eller ikke er en kovalent lukket sirkel, vikles tett inn i en kondensert konfigurasjon, som en ball av garn. Disse to klassene av virus antar i det første tilfellet en lang, utvidet stavformet struktur og i andre tilfelle en symmetrisk polygon.det desidert best studerte eksempelet på et spiralformet stavformet virus er tobaksmosaikkviruset, som Ble krystallisert Av Wendell Stanley i 1935. Tobaksmosaikkviruset inneholder et genom av enkeltstrenget RNA innkapslet av 2,130 molekyler av et enkelt protein; det er 161/3 proteinmolekyler for HVER tur AV RNA-helixen i forholdet mellom tre nukleotider for hvert proteinmolekyl.
Tobakk mosaikk virus
Encyclopediaæ Britannica, Inc.
under de rette miljøforholdene vil virale RNA og proteinmolekyler i flytende suspensjon samle seg til et perfekt formet og fullt smittsomt virus. Lengden av det spiralformede viruskapsid bestemmes av lengden av nukleinsyremolekylet, som er rammen for samlingen av kapsidproteinet. De forskjellige spiralformede virusene har forskjellige lengder og bredder, avhengig av størrelsen på nukleinsyren, samt på masse og form av proteinmolekylet. Noen av disse spiralformede virusene danner stive stenger, mens andre danner fleksible stenger, avhengig av egenskapene til de samlede proteiner.Polygonale virus varierer sterkt i størrelse, fra 20 til 150 nm i diameter, i hovedsak proporsjonal med størrelsen på nukleinsyremolekylet spolet opp inne i virionen. De fleste, om ikke alle, av de polygonale virusene er icosahedral; som en geodetisk kuppel, dannes de av like-sidige trekanter, i dette tilfellet 20. Hver trekant består av proteinunderenheter (kapsomerer), ofte i form av heksoner (multipler av seks) som er byggesteinene til kapsid. Det er 12 hjørner (de apikale kryssene til disse 20 trekanter), hver bestående av en penton (fem underenheter). Disse icosahedral virions har tre akser av femfoldig, trefoldig og todelt rotasjonssymmetri. Antall kapsomerer er et grunnlag for taksonomisk klassifisering av disse virusfamiliene. Visse icosahedral virus, vanligvis de som er mer komplekse, inneholder interne proteiner som holder seg til nukleinsyren som ikke er tilgjengelige på overflaten av virionene.
Encyclopediaæ Britannica, Inc.