als afgestudeerde student is het onderwijzen van biology labs een vast onderdeel van mijn week en het lab dat ik de meeste kwartalen geef, gaat over fylogenetica en biodiversiteit. Onlangs heb ik discussies gehad over fylogenetische termen met mijn studenten, collega TAs, en het personeel en de professoren die de leiding hebben over de klas. Terminologie wordt vaak verwarrend in fylogenetica, en woorden worden soms gebruikt om verschillende dingen te betekenen door verschillende mensen. Een van de facetten die deze termen extra verwarrend maakt is dat ze elkaar niet uitsluiten en afhankelijk zijn van de groepen die worden besproken, dus bijvoorbeeld, een eigenschap kan zowel een synapomorfie als een autapomorfie zijn (zie hieronder) afhankelijk van de groepen die worden onderzocht. Dus, in een poging om dingen op te helderen in mijn eigen geest, en dus hopelijk in staat zijn om ze effectiever te leren, hier zijn een aantal veelgebruikte termen in cladistiek met bijbehorende definities en verklaringen.
Apomprphy-een afgeleide karakterstatus. Dit is alles wat een innovatie is langs een evolutionaire lijn. Dus alles wat anders is dan de voorouderlijke karaktertoestand. Bijvoorbeeld, binnen de phylum Chordata, zou de evolutie van een wervelkolom, die iets is dat lijnen die eerder vertakt in de Chordaatevolutie niet hebben en zo nieuw is in de klasse gewervelde, een apomorfie zijn.
synapomorfie-een gedeelde, afgeleide karakterstatus. Dit is een apomorfie die twee taxa delen en die verondersteld wordt aanwezig te zijn geweest in de gemeenschappelijke voorouder van deze twee taxa. Een voorbeeld zijn veren in vogels. Alle vogels hebben veren, en er wordt aangenomen dat ze veren hebben omdat de gemeenschappelijke voorouder van alle vogels veren had en dat kenmerk door de generaties heen doorgegeven heeft.
Plesiomorphy – een voorouderlijke karakterstatus. Dit is elke eigenschap die werd geërfd van de voorouder van een groep. Reptielen zijn bijvoorbeeld exotherm, ze houden geen constante inwendige lichaamstemperatuur. Ze hebben deze eigenschap omdat de voorouder van alle reptielen exotherm was. Dit verschilt van een synapomorfie omdat sommige afstammelingen van de eerste reptielen niet exotherm zijn (vogels zijn endotherm). Met andere woorden, Deze eigenschap is voorouderlijk, maar wordt gedeeld door sommige, maar niet alle, van die voorouders; afstammelingen.
Symplesiomorphy-een gedeelde, voorouderlijke karakterstatus. Dit is elke eigenschap die werd geërfd van de voorouder van een groep en is doorgegeven aan meer dan één afstammeling. Om verder te gaan met het voorbeeld voor een plesiomorfie, het feit dat krokodillen en schildpadden beide exotherm zijn, maar
autapomorfie – een afgeleide eigenschap die uniek is voor een bepaalde taxa. Deze zijn niet nuttig om te bepalen hoe groepen gerelateerd zijn, aangezien slechts één groep de specifieke eigenschap zal hebben. Deze zijn echter zeer nuttig bij het identificeren van taxa. Veren komen bijvoorbeeld alleen voor bij vogels. Dit maakt het karakter “feathers” en autapomorphy voor klasse Aves. Het karakter “feathers” is ook een synapomorfie voor taxa binnen klasse Aves. Roofvogels en zangvogels hebben beiden veren en ze erven ze van een gemeenschappelijke voorouder.
Open circles = ancestral character state, filled circles = derived character state.
Lees het volledige bericht ”