några av öarna användes för säsongsbetonade fiskeläger av ursprungsbefolkningar och bosatte sig först av Europas i början av 17-talet. De blev ett av de många fiskeområdena för de unga brittiska och franska kolonierna. Detta var en av de nordligaste fiskehamnarna, den närmaste söderut var Rockport, Massachusetts. Isles Of Shoals fick namnet ”Smith Iles” av den engelska Utforskaren John Smith efter att ha sett dem 1614. Detta namn varade inte när koloniseringen av New England av britterna började. Den första inspelade landfallet för en engelsman var Utforskaren kapten Christopher Levett, vars 300 fiskare i sex fartyg upptäckte att öarna av Stimar till stor del övergavs 1623.”den första platsen jag satte min fot på i New England var Isle of Shoals, som var öar i havet ungefär två ligor från main”, skrev Levett senare. ”På dessa öar kunde jag varken se ett bra timmerträd eller så mycket bra mark som att göra en trädgård. Platsen visar sig vara en bra fiskeplats för sex fartyg, men mer kan inte vara bra där, för brist på bekvämt scenrum, som årets erfarenhet har visat sig.”
år 1628 förflyttade Plymouth-pilgrimerna Thomas Morton på ön på grund av hans libertinska aktiviteter med indianerna vid Merrymount.
den första staden,” Apledoore”, inkluderade alla Isles Of Shoals och införlivades av tribunalen i Massachusetts Bay Colony den 22 maj 1661. Vid den tiden var provinsen New Hampshire och provinsen Maine båda en del av Massachusetts Bay Colony. År 1665 hade stadens namn ändrats till ”Iles of Shoales”. Från och med 1680 och fortsatte i flera år skedde en allmän migration av befolkningen till Star Island i det som nu är New Hampshire, avgår från Hog Island (nu känd som Appledore) i det som nu är Maine. År 1696 annekterades staden av Kittery. År 1715 township of Gosport grundades av New Hampshire på Star Island.Gosport-samhället var ganska välmående fram till omkring 1778, då öborna evakuerades till Rye, New Hampshire, på grund av revolutionskriget. Även om en liten befolkning kvar, öarna var till stor del övergivna fram till mitten av 19-talet, när Thomas Laighton och Levi Thaxter öppnade en populär sommar hotell på Appledore Island. Laighton dotter, Celia, gift Levi vid en ålder av femton och som Celia Thaxter blev den mest populära amerikanska kvinnliga poeten av 19th century. Hon var värd för en konstgemenskap på ön som besöks av författare inklusive Nathaniel Hawthorne, John Greenleaf Whittier, Oliver Wendell Holmes och Sarah Orne Jewett, och den impressionistiska målaren Childe Hassam. Efter att ha utfört sin sista ritning tre dagar tidigare drunknade Boston-målaren William Morris Hunt där 1879, enligt uppgift ett självmord. Hunts kropp upptäcktes av Celia Thaxter.populariteten hos Laightons Appledore House ledde snart till etableringen av Mid-Ocean House på Smuttynose Island och Oceanic Hotel, som fortfarande används idag på Star Island.
