El primer acelerador de semillas fue Y Combinator, iniciado en Cambridge, Massachusetts, en 2005, y luego trasladado a Silicon Valley por Paul Graham. Fue seguido por TechStars (en 2006), Seedcamp (en 2007), AngelPad (en 2010), Startupbootcamp (en 2010), Tech Wildcatters (en 2011), varios aceleradores de SOSV y Boomtown Boulder (2014).
En Europa, el primer programa de aceleración fue iniciado por Accelerace en 2009 en Dinamarca (fuertemente subvencionado por el gobierno danés) seguido poco después por Startup Wise Guys en 2012 en Estonia.
Con la creciente popularidad de los programas aceleradores de semillas en los Estados Unidos, Europa ha visto un aumento de aceleradores para apoyar un ecosistema de startups en crecimiento. Los programas aceleradores de semillas mejor valorados en Europa incluyen Seedcamp (con sede en Londres), HighTechXL (con sede en Eindhoven), Startupbootcamp (acelerador paneuropeo con ubicaciones de programas y espacios de oficina con sede en Copenhague, Ámsterdam, Berlín, Israel, Eindhoven, Estambul y Londres) y Startup Wise Guys (acelerador de empresas B2B con más experiencia en Europa).
Forbes publicó un análisis de aceleradores de startups en abril de 2012. Desde 2010 ha habido un crecimiento sustancial de los programas de Aceleración Corporativa, que están patrocinados por organizaciones establecidas pero siguen principios similares.
En 2011 Matthew Clifford y Alice Bentinck, anteriormente consultores de gestión en McKinsey & Company, cofundaron Entrepreneur First, una aceleradora con sede en Londres que guía a graduados prometedores de tecnología y a quienes ya trabajan en empresas tecnológicas para diseñar y dirigir sus propias startups. Entrepreneur First se diferencia de otros aceleradores como Y Combinator y Wayra en que trabaja con individuos en lugar de empresas.
Con la aparición de la pandemia de COVID-19, muchos aceleradores como Y Combinator, la familia de aceleradores de SOSV y BEAMSTART han cambiado sus enfoques al ejecutar la mayoría de los programas y Días de Demostración en línea.