La papila de Vater participa en la regulación del flujo biliar (inhibición y facilitación) en el duodeno y la prevención del reflujo en el sistema de conductos biliares y pancreáticos. Estas funciones se logran mediante una estructura muscular, neuronal y mucosa especial de la papila de Vater. La mucosa de la papila de Vater consiste en un complicado sistema de pliegues de la mucosa que puede funcionar como una válvula antirreflujo o incluso podría participar en la regulación del flujo de salida de bilis. El músculo liso del esfínter de Oddi difiere anatómica y embriológicamente del músculo duodenal circundante. Muestra actividad eléctrica y mecánica espontánea que actúa independientemente del duodeno, pero integrada en la función general del tracto gastrointestinal por mecanismos miogénicos, nervios extrínsecos e intrínsecos y hormonas circulantes. Una actividad eléctrica miogénica espontánea se propaga distalmente y conduce a contracciones fásicas de propagación distal. Con la manometría endoscópica en humanos se pueden medir estas contracciones fásicas, así como el tono basal, la presión del conducto biliar y la presión del conducto pancreático. Los cambios en el tono basal y la actividad fásica alterarán la resistencia al flujo regulando así el flujo biliar e induciendo el llenado de la vesícula biliar. El rasgo más característico del esfínter de Oddi es el efecto inhibitorio de la colecistoquinina, que es un poderoso contratista de la vesícula biliar, sobre el esfínter de la actividad motora de Oddi. La colecistoquinina liberada en respuesta a la grasa intraduodenal y otros nutrientes podría ser el estímulo fisiológico del aumento del flujo biliar posprandial. La función de otras hormonas es todavía bastante especulativa y su significado fisiológico espera una confirmación adicional.
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