El nombre Triops proviene del griego τρία(tría) que significa «tres» y opsψ (ops) que significa «ojo». La cabeza de T. longicaudatus tiene un par de ojos compuestos dorsales que se encuentran uno cerca del otro y están casi fusionados. Los ojos compuestos son generalmente sésiles (no acechados). Además, hay un ocelo naupliar (el «tercer ojo») entre ellos. Los ojos compuestos están en la superficie de la cabeza, pero el ocelo está en lo profundo de la cabeza. Todos los ojos, sin embargo, son fácilmente visibles a través de la cubierta de la cabeza.
Franz von Paula Schrank fue el primer autor en usar el nombre del género Triops, acuñándolo en su trabajo de 1803 sobre la fauna de Baviera. Su nombre en alemán era Dreyauge, que significa «tres ojos». Recolectó y describió especímenes de la misma localidad de Ratisbona de la que Schäffer, otro naturalista que había estudiado la Notostraca, obtuvo sus especímenes en la década de 1750. Sin embargo, otros autores, comenzando por Louis Augustin Guillaume Bosc, habían adoptado el nombre de género Apus para los organismos que Schrank había nombrado Triops
Ludwig Keilhack usó el nombre de género Triops en su clave de identificación de campo de 1909 de la fauna de agua dulce de Alemania. Sugirió que el nombre del género Apus fuera reemplazado por Triops Schrank, ya que un género de aves ya había sido descrito por Giovanni Antonio Scopoli bajo el nombre Apus. Sin embargo, Robert Gurney prefirió el nombre de Apus Schäffer. Sugirió que el nombre «Tri Triops Schrank, puede ser devuelto a la oscuridad de la que fue desenterrado». Esta controversia continuó y no se resolvió hasta la década de 1950.
En su revisión taxonómica de Notostraca de 1955, Alan R. Longhurst apoyó el nombre de género de Keilhack Triops sobre Apus. Longhurst proporcionó evidencia histórica para apoyar esta posición. La Comisión Internacional de Nomenclatura Zoológica (ICZN) siguió a Longhurst en su decisión de 1958 sobre el uso y el origen de los nombres de género Triops y Apus. Rechazaron el nombre de género Apus y en su lugar reconocieron el nombre de género Triops Schrank, 1803 (nombre ICZN no. 1246).
Aunque la taxonomía del género no se ha revisado desde 1955, se reconocen las siguientes especies:
- Triops australiensis (Spencer & Hall, 1895)
- Triops baeticus Korn, 2010
- Triops cancriformis (Bosc, 1801)
- Triops emeritensis Korn & Pérez-Bote, 2010
- Triops gadensis Korn & García-de-Lomas, 2010
- Triops granarius (Lucas, 1864)
- Triops longicaudatus (LeConte, 1846)
- Triops mauritanicus Ghigi, 1921
- Triops newberryi Thomas, 1921
- Triops vicentinus Korn, Machado, Cristo & Cancela da Fonseca, 2010
T. mauritanicus fue considerada una subespecie de T. cancriformis por Longhurst en 1955, pero Korn et al. en 2006.
Tenga en cuenta que para varias de estas especies hay diferentes variedades, algunas de las cuales se han sugerido recientemente como subespecies e incluso especies separadas. T. longicaudatus, por ejemplo, puede ser en realidad varias especies agrupadas, y T. cancriformis generalmente se reconoce que tiene tres subespecies: T. cancriformis cancriformis, T. c. mauretanicus y T. c. simplex. Además, la forma albina tiene el nombre especial de T. cancriformis var. Beni-Kabuto Ebi.