En tant qu’étudiant diplômé, l’enseignement des laboratoires de biologie est une partie régulière de ma semaine et le laboratoire que j’enseigne la plupart des trimestres est sur la phylogénétique et la biodiversité. Récemment, j’ai eu des discussions sur les termes phylogénétiques avec mes étudiants, mes collègues TAs, et le personnel et les professeurs qui sont en charge de la classe. La terminologie devient souvent déroutante en phylogénétique, et les mots sont parfois utilisés pour signifier différentes choses par différentes personnes. L’une des facettes qui rend ces termes encore plus confus est qu’ils ne s’excluent pas mutuellement et dépendent des groupes discutés, par exemple, un trait peut être à la fois une synapomorphie et une autapomorphie (voir ci-dessous) en fonction des groupes examinés. Donc, dans une tentative d’éclaircir les choses dans mon propre esprit, et donc j’espère pouvoir les enseigner plus efficacement, voici quelques termes couramment utilisés en cladistique avec des définitions et des explications qui les accompagnent.
Apomprphy – Un état de caractère dérivé. C’est tout ce qui est une innovation le long d’un lignage évolutif. Donc, tout ce qui est différent de l’état de caractère ancestral. Par exemple, dans le phylum Chordata, l’évolution d’une colonne vertébrale, qui est quelque chose que les lignées qui se sont ramifiées plus tôt dans l’évolution des Chordés n’ont pas et qui est donc nouveau dans la Classe Vertebrata, serait une apomorphie.
Synapomorphie – Un état de caractère dérivé partagé. Il s’agit d’une apomorphie que deux taxons partagent et qui est supposée avoir été présente chez l’ancêtre commun de ces deux taxons. Un exemple serait les plumes chez les oiseaux. Tous les oiseaux ont des plumes, et on suppose qu’ils ont des plumes parce que l’ancêtre commun à tous les oiseaux avait des plumes et a transmis cette caractéristique à travers les générations.
Plésiomorphie – Un état de caractère ancestral. Il s’agit de tout trait hérité de l’ancêtre d’un groupe. Par exemple, les reptiles sont exothermiques, ils ne maintiennent pas une température corporelle interne constante. Ils ont cette caractéristique car l’ancêtre de tous les reptiles était exothermique. Ceci diffère d’une synapomorphie car certains descendants des premiers reptiles ne sont pas exothermiques (les oiseaux sont endothermiques). En d’autres termes, ce trait est ancestral, mais est partagé par certains, mais pas tous, de ces ancêtres; descendants.
Symplésiomorphie – Un état de caractère ancestral partagé. Il s’agit de tout trait qui a été hérité de l’ancêtre d’un groupe et qui a été transmis à plus d’une lignée descendante. Pour continuer avec l’exemple d’une plésiomorphie, le fait que les crocodiles et les tortues sont à la fois exothermiques, mais
Autapomorphie – Un trait dérivé qui est unique à un taxon particulier. Ceux-ci ne sont pas utiles pour déterminer comment les groupes sont liés car un seul groupe aura le trait particulier. Cependant, ceux-ci sont extrêmement utiles pour identifier les taxons. Par exemple, les plumes ne se produisent que chez les oiseaux. Cela rend le caractère « plumes » et autapomorphie pour les Aves de classe. Le caractère « plumes » est également une synapomorphie pour les taxons de la classe Aves. Les rapaces et les oiseaux chanteurs ont tous deux des plumes et ils les ont héritées d’un ancêtre commun.
Cercles ouverts = état de caractère ancestral, cercles remplis = état de caractère dérivé.
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